Mediante líneas de investigación el grupo plantea la búsqueda de herramientas que permitan comprender la biología de diversos organismos: Línea en Interacciones moleculares Línea en Miméticos funcionales Línea en Sustancias bioactivas para el control de patógenos

• INTERACCIÓNES MOLECULARES
• MIMÉTICOS FUNCIÓNALES
• SUSTANCIAS BIOACTIVAS PARA EL CONTROL DE PATÓGENOS

Desarrollar actividades académicas de investigación enfocadas desde la perspectiva de la bioinformática y la prospección encaminada a la solución del problema de resistencia a los agentes antimicrobianos e insecticidas.

Diseño de sustancias activas contra bacterias, hongos, parásitos, células tumorales, insectos y virus Diseño de productos basados en sustancias bioactivas Diseño de algoritmos de inteligencia artificial para la clasificación y generación de secuencias peptídicas con alto potencial como antimicrobianos

- Fortalecer las relaciones con las empresas farmaceuticas, con el fin de desarrollar proyectos conjuntos y transferir el conocimiento desarrollado y colaborando con la solución al problema de los antimicrobianos e insecticidas. - Establecer contactos con entidades relacionadas con el tema de sustancias bioactivas, para establecer nuevas cooperaciones. - Participar en eventos nacionales e internacionales en la temática de sustancias bioactivas, para divulgar los adelantos y resultados e intercambiar ideas con otros investigadores.

Centro de Excelencia en Computación Cientifica Center of Excellence in Scientific Computing: CoE-SciCo

--Fortalecimiento de las líneas de investigación del grupo Biología Funcional usando herramientas bioinformáticas para el diseño racional de péptidos

Sistema de inteligencia artificial para la predicción y generación automática de péptidos bioactivos

Validación de péptidos antimicrobianos para su uso en criopreservación de semen bovino

Búsqueda de péptidos antimicrobianos a partir del análisis de proteomas de Musa spp. mediante la plataforma informática ScreenSure para el tratamiento de Ralstonia solanacearum.

Prototipo de una máquina de inteligencia artificial para la predicción de la actividad antimicrobiana a partir del análisis de proteomas

Diseño computacional de péptidos antivirales contra la proteína de cápside del virus de la hepatitis E

Encapsulación y liberación de péptidos antimicrobianos en nanopartículas de Quitosano funcionalizadas

Los géneros de abejas (Himenóptera: Apoidea: Apiformes) del Departamento de Antioquia, Colombia.

Diversidad de abejas silvestres (Hymenóptera: Apoidea: Apiformes) asociadas a cultivos de café (Coffea arabica: Rubiaceae), su importancia en la polinización y su relación con las practicas de manejo del cultivo en el Departamento de Antioquia.

Actividad citotóxica e inmunomoduladora de péptidos sinteticos de origen natural

Bioinformática en Sistemática de Insectos: Información genética integrada, Selección y gestión de bases de datos y Análisis de calidad

DISEÑO Y EVALUACIÓN DE PÉPTIDOS SINTÉTICOS CON FUNCIÓN ANTIBACTERIANA Aplicación en criopreservación de semen bovino

Búsqueda y optimización in silico de péptidos sintéticos con actividad antibacteriana e insecticida

DISEÑO COMPUTACIONAL DE PÉPTIDOS ANTIVIRALES CONTRA LA PROTEÍNA DE CÁPSIDE DEL VIRUS DE LA HEPATITIS E

Caracterización del mecanismo de acción de peptidos antimicrobianos sintéticos, sobre bacterias de importancia médica

Detección genómica de bacteriocinas tipo II en Lactobacillus casei, Pediococcus pentosaceus, y evaluación de su actividad biológica sobre microorganismos alterantes de alimentos

Fortalecimiento de la línea "Sustancias bioactivas para el control de patógenos" usando como blancos proteínas de origen viral

Fortalecimiento de las líneas de investigación del grupo Biología Funcional usando herramientas bioinformáticas para el diseño racional de moléculas

Diseño de péptidos bioactivos a partir del análisis de proteomas de microorganismos mediante la plataforma informática ScreenSure

In silico design of polycationic antimicrobial peptides active against Psedomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus

• Design of antimicrobial and cytolytic peptides by computational analysis of bacterial, algal, and invertebrate proteomes. (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• Cytolytic activity of peptides derived from the Cry11Bb insecticidal toxin of B. thuringiensis subsp. medellin. (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• De novo design of short antimicrobial lipopeptides (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• Peptide derivatives of Dermaseptin S4 in fresh bovine semen for bacterial contamination control: Physicochemical and structural characterization, antibacterial potency, and effects on red blood and sperm cells (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• Cultivable bacteria populations on leaves of banana and plantain plants and their antagonistic activity against Mycosphaerella fijiensis. (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Electrical hypothesis of toxicity of the Cry toxins for mosquito larvae. (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• A case of incidental infection of Hepatitis E virus (HEV) genotype 1 in a domestic pig (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Enzymatic hydrolysis of molecules associated with bacterial quorum sensing using an acyl homoserine lactonase from a novel Bacillus thuringiensis strain (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Multiple response optimization of Bacillus subtilis EA-CB0015, culture and identification of antifungal metabolites (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Bioinformatic design of antimicrobial peptides for the development of multipurpose contact lens solutions (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• InverPep: A database of invertebrate antimicrobial peptides (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• DNA secondary structure formation by DNA shuffling of the conserved domains of the Cry protein of Bacillus thuringiensis. (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• In-silico design and molecular docking evaluation of peptides derivatives from bacteriocins and porcine beta defensin-2 as inhibitors of hepatitis E virus capsid protein (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Lipopeptides from Bacillus sp. EA-CB0959: Active metabolites responsable for in vitro and in vivo control of Ralstonia solanacearum. (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• In silico design of polycationic antimicrobial peptides active against Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus. (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Toxic activity, molecular modeling and docking simulations of Bacillus thuringiensis Cry11 toxin variants obtained via DNA shuffling (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Treatment of an Aedes aegypti colony with the Cry11Aa toxin for 54 generations results in the development of resistance (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Fungicide tolerance of Trichoderma asperelloides and T. harzianum strains (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Improved production of Bacillus thuringiensis by intermittent fed-batch culture with total cell retention (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Actividad lipolítica de microorganismos aislados de aguas residuales contaminadas con grasas (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• Fengycin C Produced by Bacillus subtilis EA-CB0015 (Artículos sometidos a revisión en revista indexada.)
• PepMultiFinder 2.0. 2022. Un algoritmo para buscar péptidos bioactivos en proteomas o listas de secuencias de proteínas (Desarrollo de software)
• MULTI BIO TRADUCTOR 1.0. Un algoritmo que permite traducir secuencias codificadas en ADN o ARN a proteínas. (Desarrollo de software)
• PepGen 1.0. 2022. Una herramienta informática para la generación de péptidos sintéticos antimicrobianos (Desarrollo de software)
• AmpClass 1.0. 2022. Una herramienta informática para la predicción de la actividad antimicrobiana de péptidos (Desarrollo de software)
• Sequences-Filter 1.0. Una herramienta computacional pedagógica y de investigación para el estudio de patrones o motivos cortos dentro de la secuencia de péptidos antimicrobianos. (Desarrollo de software)
• Lipopéptidos cortos con actividad antimicrobiana contra bacterias Gram negativas y Gram positivas (Patentes o su trámite)
• Péptidos sintéticos antimicrobianos para el tratamiento de infecciones cutáneas y composiciones farmacéuticas que los comprenden (Patentes o su trámite)
• Péptido sintético policatiónico como agente ionofórico, antimicrobiano, antitumoral e insecticida (Producto tecnológico)
• Programa para analizar secuencias de proteínas y seleccionar regiones con propiedades particulares (Software aplicativo especializado)
• Un programa para buscar potenciales péptidos bioactivos en secuencias de proteínas (Software aplicativo especializado)
• PepMultiFinder 1.0. Un algoritmo para buscar péptidos bioactivos en proteomas o listas de secuencias de proteínas (Software aplicativo especializado)
• Type-Peptide 1.0. Herramientas computacionales pedagógicas para el estudio, diseño y optimización de péptidos antimicrobianas basada en sus propiedades fisicoquímicas. (Software aplicativo especializado)