Proyectos
--Fortalecimiento de las líneas de investigación del grupo Biología Funcional usando herramientas bioinformáticas para el diseño racional de péptidos
Resumen
--El uso de antibióticos ha reducido la incidencia de infecciones bacterianas y muertes humanas en todo el mundo. Sin embargo, el uso permanente de antibióticos ha resultado en la aparición de microbios resistentes en entornos hospitalarios y fuera de las instalaciones médicas (Goosens et al. 2005, Arias y Murray 2009). En los últimos 30 años, solo dos clases de antibióticos verdaderamente novedosas han entrado en el mercado, las oxazolidinonas (linezolid) y la daptomicina lipopéptido cíclico, y la resistencia ya se ha documentado para ambos compuestos (Tazi et al. 2013, Tran et al. 2013). Recientemente, la Organización Mundial de la Salud ha informado de un problema de resistencia mundial en especies bacterianas como Escherichia coli, Klebsiella pneumoniae, Staphylococcus aureus, Streptococcus pneumoniae, Shigella spp. y Neisseria gonorrea (WHO, 2012, 2014); y todos ellos requerirán nuevas moléculas para su control. La resistencia a antibióticos por las cepas bacterianas multiresistentes son unos de los problemas actuales de mayor relevancia en salud pública que compromete el control de enfermedades en Colombia y en el resto del mundo. Por lo tanto es necesaria la búsqueda de nuevos agentes terapéuticos, entre los cuales se destacan como opción promisoria los péptidos antimicrobianos. La búsqueda experimental de péptidos con actividad biológica es un proceso demorado y de altos costos. Por esta razón, las estrategias y herramientas bioinformáticas han surgido como una medida efectiva para agilizar la investigación y desarrollo de estas moléculas bioactivas. Para la búsqueda eficiente de nuevas moléculas se han diseñado diversas herramientas computacionales en el Grupo Biología Funcional como Peptide ID, PepMultiFinder, Type-Peptide, Calcampi y Sequence-Filter que a partir de la selección de diversas variables fisicoquímicas comunes a los péptidos con actividad biológica experimentalmente validada, permiten el análisis de cualquier proteína, conjunto de proteínas o proteomas para buscar secuencias con alta probabilidad de ser antimicrobianos. Es así como a partir del análisis de segmentos de secuencias proteicas, se han diseñado péptidos sintéticos con actividad a concentraciones bajas micromolares contra un amplio rango de organismos que incluyen virus, bacterias, levaduras, hongos, parásitos e insectos. El grupo de investigación busca la consolidación de una plataforma basada en el uso de herramientas bioinformáticas y de inteligencia artificial enfocada en el diseño de moléculas con actividad antimicrobiana, antiparasitaria, antitumoral, a partir del estudio de proteínas y proteomas.
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:Registro único de proyectos
Modalidad:Registro único de proyectos
Responsable