El grupo Manihot biotec tiene como eje principal desarrollar investigación en yuca (Manihot esculenta) desde diferentes aspectos del conocimiento, biotecnologia, inmunidad, fitomejoramiento, recursos geneticos, genomica, etc. Su tematica central es la comprensión de las bases moleculares de la resistencia cuantitativa a la bacteriosis vascular causada por la bacteria Xanthomonas axonopodis pv. manihotis.

• FITOMEJORAMIENTO
• INMUNIDAD VEGETAL
• RESISTENCIA CUANTITATIVA DE LA YUCA

La yuca constituye el pilar de la seguridad alimentaria. Es la base de la alimentación para cerca de 1000 millones de personas en el mundo. Sin embargo se ha considerado un cultivo "huérfano" en el sentido que son relativamente pocos los esfuerzos en desarrollar investigación relacionada con el cultivo. Frente a este vacío, el grupo busca generar conocimiento a través de investigación con diferentes enfoques (biotecnología, fitomejoramiento, biología molecular, fisiología, genómica, bioinformática) que contribuya al desarrollo del cultivo de yuca.

Identificar las bases moleculares de la resistencia de la yuca a la bacteriosis vascular. Desarrollar estrategias biotecnologicas que permitan desarrollar variedades de yuca mejoradas con mayor resistencia a la bacteriosis vascular o que a futuro permitan mejorar otros caracteres agro-culinarios de la yuca.

El grupo cuenta y ha contado con la participación de profesionales de las carreras de Biología, microbiología, ciencias agrarias, biotecnología, lo que le ha dado en términos de formación de masa critica una visión interdisciplinaria. La principal problemática del grupo es el estudio de la resistencia a la bacteriosis vascular y ésta ha sido abordada desde diferentes disciplinas como la genética, la biología molecular, la genómica, la biotecnología, para lo cual hemos interactuado con diferentes profesionales (matemáticos, estadisticos, biotecnologos, etc). Hemos mantenido una estrecha colaboración con investigadores nacionales de la Universidad de lo Andes, del CIAT e internacionales con el IRD (Francia) y con el INRES (Alemania). El grupo ha liderado la creación de la red RIBY (Red Interandina de Bacteriosis de Yuca) que reune participantes de Bolivia, Paraguay, Brasil, Cuba y Argentina.

Arquitectura genética de la respuesta al anegamiento en yuca, integración de enfoques de transcriptómica y mapeo por asociación

Estudio preliminar del potencial de hojas de yuca como fuente alternativa nutricional e identificación de genes blanco para el mejoramiento de la resistencia a la bacteriosis y contenido nutricional

Diversidad genética y cultural asociada a la yuca amazónica: fuente de genes para rasgos de interés agronómico y nutricional, de cultura y saberes tradicionales

Arquitectura genética de la biología reproductiva de variedades de yuca colombiana resistentes a la bacteriosis vascular: inicio de un programa de fitomejoramiento participativo en el país

Centro de Excelencia en Genómica y Bioinformática de la Universidad Nacional de Colombia - CEGBio

Evaluación molecular de la diversidad de yuca en los Montes de María: adopción de variedades mejoradas y conservación del patrimonio biocultural de los pequeños campesinos

Desarrollo e implementación del sistema in vitro para el estudio de la interacción yuca-Xanthomonas

Uso de promotores inducibles con TALEs para la expresión de genes de resistencia autoactivos en plantas de yuca

• Using in vitro plants to study the cassava response to Xanthomonas phaseoli pv. manihotis infection (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• 6. Zárate-Chaves CA, Moufid Y, López CE, Bernal AJ, Szurek B, Yánez First report of Cassava Bacterial Blight caused by Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in the Amazonian forest of Ecuador. Plant Dis. 2024 Feb 29 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• 5. Zárate-Chaves CA, Audran C, Medina Culma CA, Escalon A, Javegny S, Gagnevin L, Thomas E, Pimparé LL, López CE, Jacobs JM, Noël LD, Koebnik R, Bernal AJ, Szurek B CRISPRi in Xanthomonas demonstrates functional convergence of transcription activator-like effectors in two divergent pathogens..New Phytol. 2023 May;238(4):1593-1604 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• 4. Díaz-Tatis PA, Ochoa JC, Rico EM, Rodríguez C, Medina A, Szurek B, Chavarriaga P, López CE RXam2, a NLR from cassava (Manihot esculenta) contributes partially to the quantitative resistance to Xanthomonas phaseoli pv. manihotis. .Plant Mol Biol. 2022 Jun;109(3):313-324. (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• 3. Rache L, Blondin L, Diaz Tatis P, Flores C, Camargo A, Kante M, Wonni I, López C, Szurek B, Dupas S, Pruvost O, Koebnik R, Restrepo S, Bernal A, Vernière C A minisatellite-based MLVA for deciphering the global epidemiology of the bacterial cassava pathogen Xanthomonas phaseoli pv. manihotis. .PLoS One. 2023 May 11;18(5):e0285491 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• Interfamily transfer of Bs2 from pepper to cassava (Manihot esculenta Crantz) • March 2019 • Tropical Plant Pathology (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• Conservación de la diversidad de yuca en los sistemas tradicionales de cultivo de la Amazonía D Pérez, R Mora, C López-Carrascal Acta Biológica Colombiana 24 (2), 202-212 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• Yuca: pan y carne, una alternativa potencial para hacer frente al hambre oculta PA DIAZ TATIS, CE LOPEZ CARRASCAL Acta Biológica Colombiana 26 (2), 235-246 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• El dominio STK de la proteína de resistencia a la bacteriosis vascular de yuca RXAM1 interactúa con una E3 Ubiquitin Ligasa J Gil, C López Acta biológica colombiana 24 (1), 139-149 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• ARABIDOPSIS MUESTRA RESISTENCIA NO-HOSPEDERO CONSTITUTIVA CONTRA Xanthomonas phaseoli pv. manihotis YP Hurtado, DI Romero, CE LOPEZ CARRASCAL Acta Biológica Colombiana 26 (3), 345-351 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• Identificación de polimorfismos en el gen RXAM1 de yuca y su asociación con la resistencia a la bacteriosis vascular ADP Barrera, J Soto-Sedano, CE LÓPEZ CARRASCAL Acta Biológica Colombiana 25 (2), 185-193 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• 1. TAL Effector Repertoires of Strains of Xanthomonas phaseoli pv. manihotis in Commercial Cassava Crops Reveal High Diversity at the Zárate-Chaves CA, Osorio-Rodríguez D, Mora RE, Pérez-Quintero ÁL, Dereeper A, Restrepo S, López CE, Szurek B, Bernal A Country Scale. .Microorganisms. 2021 Feb 4;9(2):315 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• 2. Zárate-Chaves CA, Gómez de la Cruz D, Verdier V, López CE, Bernal A, Szurek B.Cassava diseases caused by Xanthomonas phaseoli pv. manihotis and Xanthomonas cassavae. Mol Plant Pathol. 2021 Dec;22(12):1520-1537 (Artículo (se aceptan artículos que se encuentren sometidos y/o aprobados para publicación))
• Generation and evaluation of agbiogeneric glyphosate tolerant soybean plants. Julian Mora (Documento de avance o final de tesis de doctorado)
• Evaluación Del Cianuro Total De Hojas De Yuca (Manihot esculenta) Y Propuesta De Métodos De Eliminación En Diferentes Variedades De Colombia Ivan Mahecha 2023 (Documento de avance o final de tesis de maestría)
• Adaptación in vitro de las fases de elongación y enraizamiento de regenerantes de soya sometidos a condiciones de transformación genética. Meike Estrada 2021 (Documento de avance o final de tesis de maestría)
• Validación funcional mediante artTALE de un gen candidato implicado en resistencia cuantitativa de la yuca frente a la bacteriosis vascular Sebastian Rojas (Documento de avance o final de trabajo de grado (TDG))
• EXPRESIÓN DE LA PROTEINA DE RESISTENCIA BS2 EN PLANTAS DE YUCA PARA CONFERIR RESISTENCIA A BACTERIOSIS VASCULAR (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)