- Joseph Alape Ariza, Arbey Hernán Medina Rocha, Rodrigo Cabrera Pérez, Clara Isabel Bermudez-Santana, Next-generation se- quencing of postmortem molecular mark- ers to support for medicolegal autopsy Av. Carrera 30 # 45-03 - Ciudad Universitaria Edificio 421, Biología (+57 1) 3165237 - (+57 1) 3165000 EXT: 11305 Bogotá, D. C., Colombia depbiolog_fcbog@unal.edu.co [ Página 17 de 26 ] Elaboró: Clara Isabel Bermúdez Santana P R O Y E C T O C U L T U R A L , C I E N T Í F I C O Y C O L E C T I V O D E N A C I Ó N Departamento de Biología | Facultad de Ciencias | Sede Bogotá Forensic Science International: Reports, Volume 6, 2022, 100300 (Artículo con presentación de caso clínico o reportes de caso)
- Ariza, J.A., Pinzón Reyes, A, Medina-Rocha, A.H., Cabrera-Pérez, R., & Bermúdez-San- tana, C.I. (2023). In silico Functional Analy- sis of Variants in Genes Associated with Sudden Cardiac Death in Cases of the Na- tional Institute of Legal Medicine of Co- lombia Journal of Forensic Research Vol- ume 14:03, 2023 (Artículo con presentación de caso clínico o reportes de caso)
- Alape Ariza J, Medina Rocha AH, Cabrera Pérez R and Bermúdez- Santana CI (2023) Retrospective Molecular Analysis in Five Cases Probably Associated with Sudden Death the National Institute of Legal Medi- cine and Forensic Sciences of Colombia, In- ternational Journal of Forensic Sciences (Artículo con presentación de caso clínico o reportes de caso)
- Rui Faria, Deborah Triant4, Alvaro Per- domo-Sabogal, Bert Overduin8, Christoph Bleidorn,Clara Isabel Bermudez Santana, David Langenberger, Giovanni Marco DallOlio, Henrike Indrischek,Jan Aerts, Jan Engelhardt, Johannes Engelken2, Katja Lie- bal, Mario Fasold, Sofia Robb,Sonja Grath, Sree Rohit Raj Kolora, Tiago Carvalho, Wal- ter Salzburger, Vladimir Jovanovic and Katja Nowick, Introducing evolutionary bi- ologists to the analysis of big data: guide- lines to organize extended bioinformatics training courses. Evolution: Education and Outreach volume 11, Article num- ber: 8 (2018) (Artículo de reflexión o revisión)
- Bolivar-Muñoz, J., Vits, S., Bermudez-San- tana, C. I., & Galindo, J. F. (2022). Struc- tural Analysis of the Spike Protein of SARS- CoV-2 Variants and Other Betacorona- viruses Using Molecular Dynamics. Chem- physchem : a European journal of chemical physics and physical chemistry, 23(23), e202200382. https://doi.org/10.1002/cphc.202200382 (Artículo publicado en revista indexada que presente resultados originales de la investigación)
- Rojas-Cruz, A. F., Gallego-Gómez, J. C., & Bermúdez-Santana, C. I. (2022). RNA struc- ture-altering mutations underlying positive selection on Spike protein reveal novel pu- tative signatures to trace crossing host- species barriers in Betacoronavirus. RNA biology, 19(1), 10191044. https://doi.org/10.1080/15476286.2022.2 115750 (Artículo publicado en revista indexada que presente resultados originales de la investigación)
- Rojas-Cruz, A. F., & Bermúdez-Santana, C. I. (2023). Computational Prediction of RNA-RNA Interactions between Small RNA Tracks from Betacoronavirus Nonstructural Protein 3 and Neurotrophin Genes during Infection of an Epithelial Lung Cancer Cell Line: Potential Role of Novel Small Regula- tory RNA. Viruses, 15(8), 1647. (Artículo publicado en revista indexada que presente resultados originales de la investigación)
- Ariza, J.A., Medina-Rocha, A.H., Cabrera- Pérez, R., & Bermúdez-Santana, C.I. (2023). Prevalence of Genetic Variants As- sociated with Sudden Cardiac Death in a Population Sample in Colombia. Journal of Clinical & Anatomic Pathology. (Artículo publicado en revista indexada que presente resultados originales de la investigación)
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- Nicolas Calderon K, Fabian Galindo J, Ber- mudez-Santana CI. Evaluation of Con- served RNA Secondary Structures within and between Geographic Lineages of Zika Virus. Life (Basel). 2021 Apr 14;11(4):344. doi: 10.3390/life11040344. PMID: 33919874; PMCID: PMC8070784. (Artículo publicado en revista indexada que presente resultados originales de la investigación)
- Parra-Rincón, E., Velandia-Huerto, C. A., Gittenberger, A., Fallmann, J., Gatter, T., Brown, F. D., Stadler, P. F., & Bermúdez- Santana, C. I. (2021). The Genome of the "Sea Vomit" Didemnum vexillum. Life (Ba- sel, Switzerland), 11(12), 1377. https://doi.org/10.3390/life11121377 (Artículo publicado en revista indexada que presente resultados originales de la investigación)
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- Garcia, T., Duitama, J., Zullo, S. S., Gil, J., Ariani, A., Dohle, S., Palkovic, A., Skeen, P., Bermudez-Santana, C. I., Debouck, D. G., Martínez-Castillo, J., Gepts, P., & Chacón- Sánchez, M. I. (2021). Comprehensive ge- nomic resources related to domestication and crop improvement traits in Lima bean. Nature communications, 12(1), 702. https://doi.org/10.1038/s41467-021- 20921-1 (Artículo publicado en revista indexada que presente resultados originales de la investigación)
- Álvarez-Díaz, D. A., Gutiérrez-Díaz, A. A., Orozco-García, E., Puerta-González, A., Bermúdez-Santana, C. I., & Gallego-Gó- mez, J. C. (2019). Dengue virus potentially promotes migratory responses on endo- thelial cells by enhancing pro-migratory soluble factors and miRNAs. Virus re- search, 259, 6876. https://doi.org/10.1016/j.vi- rusres.2018.10.01 (Artículo publicado en revista indexada que presente resultados originales de la investigación)
- EVOLUTIONARY GENOMICS AND SYSTEMS BIOLOGY (CAPÍTULO DE LIBRO)
- Nonprotein-Coding RNAs as Regulators of Development in Tunicates: Marine Organisms as Model Systems in Biology and Medi- cine Series: Results and problems in cell differentiation: Agosto 2018 / Springer Interna- tional Publishing AG, part of Springer Na- ture 2018 (Capitulo de libro resultado de investigación)
- TOPOLOGÍAS DE ALEXANDROFF: TRES PUNTOS DE VISTA DIFERENTES (DIRECCIÓN DE TESIS)
- PROPERTIES AND GENERALIZATIONS OF THE FIBONACCI WORD FRACTAL. EXPLORING FRACTAL CURVES (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- A GEOMETRICAL CONSTRUCTION OF INVERSE POINTS WITH RESPECT TO AN ELLIPSE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- BIPERIODIC FIBONACCI WORD AND ITS FRACTAL CURVE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- A GENERALIZATION OF THE FIBONACCI WORD FRACTAL AND THE FIBONACCI SNOWFLAKE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- ON THE K-FIBONACCI WORDS (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- PRETOPOLOGICAL SPACES AS A CLASSIFICATION TOOL FOR
RNAS REPRESENTED AS A SUCCESSION (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- ORTHOLOGS, TURN-OVER, AND REMOLDING OF TRNAS IN PRIMATES AND FRUIT FLIES (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- Homology-Based Annotation of Non-coding RNAs in the Genomes of Schistosoma mansoni and Schistosoma japonicum (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- Evidence for human microRNA-offset RNAs in small RNA sequencing data (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- APLICACIONES DE LA BIOINFORMÁTICA EN LA MEDICINA:
EL GENOMA HUMANO.
¿CÓMO PODEMOS VER TANTO DETALLE? (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- GENOMIC ORGANIZATION OF EUKARYOTIC TRNAS (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- IDENTIFICATION AND CLASSIFICATION OF SMALL RNAS IN TRANSCRIPTOME SEQUENCE DATA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- CHARACTERIZACION AND COMPARISON OF ESCHERICHIA COLI TRANSFER RNAS BY GRAPH THEORY BASED ON SECONDARY STRUCTURE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- AUTOMATED DETECTION OF NCRNAS IN THE DRAFT GENOME SEQUENCE OF A COLONIAL TUNICATE: THE CARPET SEA SQUIRT DIDEMNUM VEXILLUM (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- TRNA STRUCTURE FROM A GRAPH AND QUANTUM THEORETICAL PERSPECTIVE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
- BUSCANDO AGUJAS EN UN PAJAR: VIAJES DE RNAS PEQUEÑOS IN SILICO E IN VITRO (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA NO RECONOCIDA POR COLCIENCIAS)
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