Grupos de investigación
Rnomica teórica y computacional
Presentacion
Es un grupo de caracter interdisciplinario que tiene como objeto el estudio RNAs desde el punto de vista genómico y postgenómico. Las actividades del grupo se desarrollan gracias a la integración de conceptos de las ciencias biológicas, la química, las matemáticas y las ciencias de la computación. Como meta a corto y mediano plazo propende por la creación de herramientas computacionales, construcción de modelos para resolver preguntas básicas de la biología y evolución de los RNAs y de aplicación en diferentes áreas como la medicina y sectores afines.
Líder
Sedes
Bogotá
Dependencias
2- FACULTAD DE CIENCIAS
Otras dependencias
  • 2- INSTITUTO DE GENÉTICA
Planes de estudio
  • MAESTRIA EN NEUROCIENCIAS
  • MAESTRIA EN CIENCIAS - BIOLOGIA
  • MAESTRÍA EN BIOINFORMÁTICA
  • BIOLOGÍA - SEDE BOGOTÁ ACUERDO 033
  • DOCTORADO EN CIENCIAS BIOLOGIA
Agendas de conocimiento
Salud y Vida
Agendas del conocimiento secundarias
  • Tecnologías de la Información y Comunicaciones
  • Biotecnología
Áreas OCDE
Ciencias naturales - Ciencias de la computación y ciencias de la información
Áreas OCDE secundarias
  • Ciencias médicas y de la salud - Biotecnología en salud
  • Ciencias naturales - Ciencias de la computación y ciencias de la información
Lineas de investigación
  • BIOLOGIA COMPUTACIONAL
  • EVOLUCIÓN A ESCALA GENÓMICA
  • MATEMATICAS APLICADAS A LAS CIENCIAS
  • GENOMICA COMPARATIVA
  • MODELAMIENTO DE ESTRUCTURA DE ACIDOS NUCLEICOS
  • ANALISIS DEL TRANSCRIPTOMA
  • MODELAMIENTO DE DATOS MOLECULARES DE RNAS
  • ANÁLISIS GENÓMICO COMPARATIVO PARA IDENTIFICAR GENES DE RIESGO
Enfoque estratégico
Es un grupo de caracter interdisciplinario que tiene como objeto la modelación de datos genómicos y postgenómicos de RNAs y moléculas afines. Propende por el uso integrado de conceptos de las ciencias biológicas, la química, las matemáticas y las ciencias de la computación para resolver problemas en el área. Como meta a corto y mediano plazo propende por la creación de herramientas computacionales, construcción de modelos para resolver preguntas básicas de la biología y evolución de los RNAs y de aplicación en diferentes áreas como la medicina y sectores afines.
Prioridades de investigación
1. Investigación sobre RNomica por medio del trabajo de laboratorio en biocomputo in situ. 2. Análisis de datos genómicos, postgenómicos utilizando técnicas de modelaje de estructuras secundarias de RNAs y su relación con la función en la célula. 3. Aplicaciones de las matemáticas para modelamiento del RNA y del transcriptoma. 4. Aplicación de matematicas discretas al modelaje de datos genómicos y postgenómicos
Perspectiva interdisciplinaria
El grupo de investigación ha consolidado trabajo internacional con el grupo de Bioinformática de la Universidad de Leipzig y El Max Plank para Matemáticas aplicadas en la Ciencia en Leipzig, Alemania. Igualmente el grupo de Matemáticas aplicadas de la Universidad de Ljubljana en Slovenia es colaborador activo.
Integrantes
Proyectos
Productos
  • EVOLUTIONARY GENOMICS AND SYSTEMS BIOLOGY (CAPÍTULO DE LIBRO)
  • TOPOLOGÍAS DE ALEXANDROFF: TRES PUNTOS DE VISTA DIFERENTES (DIRECCIÓN DE TESIS)
  • IDENTIFICATION AND CLASSIFICATION OF SMALL RNAS IN TRANSCRIPTOME SEQUENCE DATA (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • GENOMIC ORGANIZATION OF EUKARYOTIC TRNAS (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • APLICACIONES DE LA BIOINFORMÁTICA EN LA MEDICINA: EL GENOMA HUMANO. ¿CÓMO PODEMOS VER TANTO DETALLE? (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • Evidence for human microRNA-offset RNAs in small RNA sequencing data (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • Homology-Based Annotation of Non-coding RNAs in the Genomes of Schistosoma mansoni and Schistosoma japonicum (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • ORTHOLOGS, TURN-OVER, AND REMOLDING OF TRNAS IN PRIMATES AND FRUIT FLIES (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • PRETOPOLOGICAL SPACES AS A CLASSIFICATION TOOL FOR RNAS REPRESENTED AS A SUCCESSION (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • CHARACTERIZACION AND COMPARISON OF ESCHERICHIA COLI TRANSFER RNAS BY GRAPH THEORY BASED ON SECONDARY STRUCTURE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • AUTOMATED DETECTION OF NCRNAS IN THE DRAFT GENOME SEQUENCE OF A COLONIAL TUNICATE: THE CARPET SEA SQUIRT DIDEMNUM VEXILLUM (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • TRNA STRUCTURE FROM A GRAPH AND QUANTUM THEORETICAL PERSPECTIVE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • ON THE K-FIBONACCI WORDS (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • A GENERALIZATION OF THE FIBONACCI WORD FRACTAL AND THE FIBONACCI SNOWFLAKE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • BIPERIODIC FIBONACCI WORD AND ITS FRACTAL CURVE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • A GEOMETRICAL CONSTRUCTION OF INVERSE POINTS WITH RESPECT TO AN ELLIPSE (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • PROPERTIES AND GENERALIZATIONS OF THE FIBONACCI WORD FRACTAL. EXPLORING FRACTAL CURVES (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA)
  • BUSCANDO AGUJAS EN UN PAJAR: VIAJES DE RNAS PEQUEÑOS IN SILICO E IN VITRO (PUBLICACIÓN EN ARTÍCULO DE REVISTA NO RECONOCIDA POR COLCIENCIAS)