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Instituto de Genética
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Grupos de investigación
BIOINFORMÁTICA Y BIOLOGÍA DE SISTEMAS
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Presentacion
Nuestro objetivo principal consiste en comprender las propiedades emergentes que surgen de la interacción entre el ambiente y el comportamiento en red de los sistemas biológicos. Visitanos en: http:www.genetica.unal.edu.co/gibbs
Líder
Andrés Mauricio Pinzón Velasco
Director de la línea de investigación en Modelado Computacional.
Sedes
Bogotá
Dependencias
2- INSTITUTO DE GENÉTICA
Planes de estudio
MAESTRIA EN NEUROCIENCIAS
MAESTRÍA EN BIOINFORMÁTICA
MAESTRIA EN GENETICA HUMANA
Agendas de conocimiento
Salud y vida
Agendas del conocimiento secundarias
Ambiente y Biodiversidad
Biotecnología
Tecnologías de la Información y Comunicaciones
Áreas OCDE
Ciencias naturales - Ciencias biológicas
Áreas OCDE secundarias
Ingeniería y tecnología - Ingenierías eléctrica, electrónica e informática
Ingeniería y tecnología - Ingeniería médica
Lineas de investigación
ESTADÍSTICA GENOMICA
INTELIGENCIA ARTIFICIAL
DESARROLLO DE MODELOS
Enfoque estratégico
El Grupo de Investigación en Bioinformática y Biología de Sistemas Computacional (GIBBS), se enfoca en el desarrollo y aplicación de modelos computacionales para la comprensión de los mecanismos moleculares detrás de los procesos de enfermedad y salud en humanos y animales, así como en la integración de dichos modelos con información proveniente de tecnologías de secuenciación de alto rendimiento con el fin de desarrollar más y mejores métodos y herramientas de utilidad en salud.
Prioridades de investigación
Nuestra prioridad de investigación se centra en el estudio de biología de redes en enfermedades neurodegenerativas. Así como en el desarrollo de aplicaciones que permitan la automatización de los procesos de reconstrucción de modelos computacionales de redes biológicas, en organismos humanos y no humanos, que puedan ser utilizados tanto para los fines de investigación del grupo, como por la comunidad científica en general.
Perspectiva interdisciplinaria
Dada su naturaleza computacional y al desarrollo de métodos y modelos computacionales de amplia utilización, GIBBS es un laboratorio de actividad transversal que además de liderar sus propias lineas de investigación, apoya también las necesidades computacionales de otros laboratorios en biología húmeda, en proyectos de análisis de RNAseq, y genómica comparativa y funcional entre otros. Desde su inicio GIBBS trabaja en proyectos conjuntos con los grupos de neurociencias, inmunología molecular, muerte celular y genética clínica del instituto de genética, así como el grupo de bioquímica estructural y bioinformática de la universidad Javeriana y el laboratorio de biología de sistemas computacional de la Universidad de Virginia en EEUU, entre otros. Actualmente GIBBS se encuentra en gestionando una serie de alianzas con algunos laboratorios en Biología de Sistemas en el continente asiático.
Integrantes
Co-directores
Estudiantes Líderes
Docentes
JUAN DAVID GARCIA ARTEAGA
Director de la linea de investigación en Aprendizaje de Máquinas en Sistemas Biológicos.
CESAR ERNESTO PAYAN GOMEZ
Miembro de la línea en Estadística Genómica.
LILIANA LOPEZ KLEINE
Directora de la Línea de Investigación en Genómica Estadística
Estudiantes de doctorado
Estudiantes de especialización y maestría
Estudiantes de pregrado
Estudiantes Visitantes
Egresados
Externos
Proyectos
Identificación de biomarcadores transcriptómicos relacionados con procesos oncogénicos en cáncer orofaríngeo de pacientes VPH positivos
CENTRO DE EXCELENCIA EN FARMACOEPIDEMIOLOGÍA Y POLÍTICAS PÚBLICAS
Centro de Excelencia en Computación Cientifica Center of Excellence in Scientific Computing: CoE-SciCo
Aplicación de métodos kernel a la determinación de proteínas implicadas en la virulencia y la adaptación de patógenos usando datos genómicos y post-genómicos
Obtención automática de datos genómicos y post-genómicos para la creación de una base de datos con miras a aplicaciones en biología de sistemas
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Análisis del efecto de la cafeína en un modelo computacional de interacción neurona dopaminérgica /astrocito, en relación a la enfermedad de Parkinson idiopático
A Novel Method For Enzyme Function Prediction By Combining Networks From Whole Genomic Datasets
Implementación y valoración de una estrategia pedagógica para el desarrollo de habilidades en las áreas de Genómica y Bioinformática, basada en el uso de secuenciación genómica y entornos virtuales para el trabajo colaborativo y el desarrollo de proyectos de investigación de alto impacto.
ANÁLISIS DE PERFILES GLOBALES DE EXPRESIÓN GÉNICA, TEJIDO ESPECÍFICOS, EN PACIENTES CON HIPOSPADIAS NO SINDRÓMICAS, ESTUDIO PILOTO.
Estudio del uso de elicitores de origen biótico en el clavel (Dianthus caryophyllus L) para el control del marchitamiento vascular: Una alternativa al uso de fungicidas de origen sintético
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Bioprospección del potencial terapéutico de extractos vegetales de las familias luraceae y rutaceae asociados a la actividad farmacologica de LXR en un modelo murino de enfermedad de Alzheimer y análisis computacional
Caracterización molecular y farmacogenética en una muestra de pacientes con Leucemia Mieloide Aguda y su correlación con la estratificación del riesgo y respuesta al tratamiento. Una aproximación hacia los patrones moleculares de la Leucemia Mieloide Aguda Pediátrica en población colombiana
Modulación de la floración en Cannabis sp. a partir de interrupción de la noche
Productos
El grupo no tiene productos asociados.