Proyectos
Caracterización de proteínas relacionadas con tolerancia a estrés hídrico en palma de aceite, mediante proteómica
Resumen
La productividad de los cultivos se ve afectada por factores bióticos y abióticos, algunos de ellos controlables y manejables y otros como los climáticos que por su naturaleza no son controlables. El déficit hídrico es la resultante de periodos de sequía prolongados, estos periodos se presentan en tres de las cuatro zonas palmeras del país con duraciones entre tres y ocho meses que repercuten directamente sobre la fisiología de las palmas en detrimento de su productividad. Para este problema las alternativas de manejo son limitadas, debido a dos factores: zonas sin infraestructura para riego y una reducción en la disponibilidad del recurso hídrico a causa del deterioro del medio de las cuencas hidrográficas. El análisis de las respuestas de las plantas a condiciones extremas es una ruta muy importante para el descubrimiento de genes que confieren tolerancia al estrés y su uso en programas de mejoramiento. El análisis proteómico permite tener una visión muy amplia de la respuesta de las plantas al estrés a nivel de sus proteínas. En los últimos años, este enfoque investigativo ha incrementado su sensibilidad y poder como resultado de los desarrollos en la electroforesis bidimensional en geles de poliacrilamida (2DE), detección y cuantificación de proteínas, "fingerprinting" y secuenciamiento parcial de proteínas por espectrometría de masas (MS), bioinformática y métodos de aislamiento de genes. Con el desarrollo de este proyecto de investigación se van a identificar proteínas diferencialmente expresadas bajo condiciones de déficit hídrico en palma de aceite lo que permitirá acercarnos a entender su función fisiológica y junto con el monitoreo de variables ecofisiológicas poder desarrollar herramientas de selección de materiales que toleren condiciones de déficit hídrico. Los resultados obtenidos con el desarrollo del proyecto permitirán ser aplicados para el análisis y selección de otros materiales de palma para ambientes de poca disponibilidad hídrica, lo que conllevará a una disminución proporcional en el costo de producción y una mayor rentabilidad para los productores dado que al tener material apto para dichas regiones repercutirá en menores costos de producción y mayor rendimiento. Mediante proteómica se realizará análisis del perfil de proteínas diferencialmente expresadas por efecto de déficit hídrico en palma de aceite, para ello se realizarán análisis de electroferogramas bidimensionales, se compararán las proteínas expresadas diferencialmente bajo condiciones adecuadas de riego (control) y bajo déficit hídrico; se seleccionarán aquellas proteínas relacionadas con tolerancia al déficit hídrico y se identificarán para posteriormente comparar sus secuencias con proteínas reportadas en el GeneBank para de esta manera obtener una aproximación de su función fisiológica. Igualmente se medirán variables ecofisiológicas para realizar seguimiento a las plantas y correlación con lo obtenido mediante proteómica.
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:Convocatoria Nacional de Investigación 2006
Modalidad:Contrapartidas
Responsable