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Taxonomía Molecular de Odocolileus virginianus en Colombia usando el gen mitocondrial (Dloop), el gap de información a lo largo de su distribución
Resumen
El venado cola blanca (Odocoileus virginianus) es una especie de amplia distribución neotropical incluyendo Colombia. Su estado taxonómico es de continuo debate y a lo largo de su distribución se habla hasta de 38 subespecies. En el caso colombiano diferentes autores hablan de (1) la existencia de 4 subespecies (O. v. goudotii, O. v. ustus, O. v. apurensis and O. v. tropicalis), asociadas a su distribución en tierras altas o bajas, al igual que a rasgos de coloración diferentes; (2) de 3 especies diferentes (O. goudotii, O. cariacou y O. ustus) y (3) que ante la falta de información se sugiere mantenerla como una sola especie para todo el país: O. virginianus. Aunque prevalecen los estudios ecológicos (morfología, coloración tamaño) para explicar los diferentes escenarios sobre el número de especies o subespecies, las aproximaciones moleculares han proporcionado una valiosa herramienta para aportar al conocimiento de la taxonomía del grupo. En particular el gen mitocondrial D-loop se ha usado frecuentemente por su alta tasa de mutación que proporciona variación útil en reconstrucción filogenética: sin embargo todos estos estudios han tenido una muy baja representación de muestras colombianas. Ese vacío de información no permite hacer inferencias acerca de las posibles entidades taxonómicas presentes en Colombia. El grupo de investigación ya posee secuencias de buen número de muestras de tierras altas y bajas, pero que incluyen solamente un fragmento pequeño del D-loop (650 bp). Se requiere completar las secuencias al gen completo (1100-1150 bp) en las muestras disponibles y algunas nuevas que incluyen muestras frescas o de museo. Un buen set de datos para el gen en cuestión para las muestras de Colombia, permitirá realizar análisis filogenéticos robustos que permitan proponer la posible existencia de especies o subespecies en Colombia. Las muestras colombianas incluyen material fresco y de museo para el cual ya se cuenta con ADN genomico extraido a partir de Kit o por extracción orgánica. Se propone un analisis bioinformatico de todas las secuencias disponibles en Genbank del dloop y disenar primers que permitan amplificar segmentos pequenos (entre 200-300 bp) pues particularmente para las muestras de museo se han tenido dificultades en amplificar fragmentos superiores a 350 bp. Se busca tener fragmentos que se sobrelapen para posteriormente establecer una secuencia consenso de cada individuo para el gen completo. El grupo de investigación cuenta con los recursos para el diseño de primers, PCR y posterior secuenciaciíon de los diferentes fragmentos. Este estudio permitirá proponer el contexto taxonómico desde el punto de vista molecular (basado en el Dloop de la mitocondria) sobre O. virginianus en Colombia.
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