Proyectos
Relaciones filogenéticas entre caballos criollos colombianos y razas españolas mediante el análisis de la región D-loop del ADN mitocondrial
Resumen
RESUMEN DEL PROYECTO Los cambios genéticos durante los procesos de selección natural, artificial y el azar conllevan a la variabilidad genética y al mejoramiento en las razas criollas por el acostumbramiento de los animales al medio ambiente, ganando rusticidad, resistencia a las enfermedades, entre otras ventajas comparado con las razas foráneas. Actualmente, estas características no han sido aprovechadas en los procesos de selección y reproducción de la especie equina dada la escasez de conocimientos de los recursos genéticos del caballo criollo colombiano. Los caballos criollos colombianos se han venido diversificando y adaptando desde su re ¿ introducción al continente americano, desarrollando características fenotípicas de conformación que les permitió dar origen a los diferentes andares propios ((Paso Fino colombiano, caballo trotador, de trocha y galope) y a caballos como el criollo llanero, lo que les proporciona un valor agregado que los hace muy apetecidos a nivel internacional. Así mismo, no existen estudios que permitan evaluar la diversidad genética, examinar las relaciones filogenéticas, realizar el análisis de las distancias genéticas y/o comparar este recurso genético criollo con razas españolas de las que se presume su origen. (Berberisco, Andaluz, Árabe). Objetivo General: Determinar los niveles de divergencia y relaciones filogenéticas entre las razas de equinos criollos colombianos y alguna razas españolas mediante el análisis de la región D-Loop del ADN mitocondrial (ADNmt). Objetivos específicos: ¿ Estudiar el polimorfismo genético del ADNmt y analizar la variabilidad genética a este nivel. ¿ Construir un árbol filogenético a partir de las secuencias generadas de la región D-Loop del ADNmt del Caballo Criollo Colombiano, comparadas con aquellas obtenidas de los caballos de razas españolas de las cuales se presume su origen. ¿ Crear una base de datos de referencia de los haplotipos generados a partir del análisis de la región D-Loop del ADN mitocondrial de los Caballos Criollos Colombianos. ¿ Realizar el análisis de las distancias genéticas para dilucidar la asociación entre grupos raciales así como con las razas españolas y evaluar el nivel de diferenciación genética que poseen los equinos criollos colombianos. Metodología: La población constará de 20 equinos no emparentados de cada raza. Se tomarán muestras de sangre y/o raíces de pelo de la crin para extracción de ADN. Posteriormente se cuantificará y diluirá el ADN, se amplificara la región hipervariable D-Loop ADNmt por PCR. La visualización de los productos amplificados se realizará por electroforesis en gel denaturante de poliacrilamida. Las diferencias genéticas entre las poblaciones se estimarán por cálculo de la distancia DA (Nei 1983) y distancia (¿¿)2 (Goldstein et al., 1995) y se alinearan con el programa de alineamiento múltiple Clustal W y las distancias genéticas entre las diferentes secuencias serán calculadas por el método de Kimura. El árbol filogenético se construirá por el método de ¿neighbour-joining¿ (Saitou and Nei, 1987). La confiabilidad en la topología del árbol se calculará con 1000 réplicas generadas por el método de bootstrapping. Los resultados esperados son: estimación de la diversidad génica así como estimación de las relaciones genéticas existentes y de las relaciones filogenéticas entre otros. Es indispensable determinar la singularidad de estos caballos así como el posterior planteamiento de estrategias de selección y de manejo reproductivo. Asimismo, crear la base de datos de referencia de los haplotipos encontrados en los Caballos Criollos Colombianos.
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:Convocatoria Nacional de Investigación 2006
Modalidad:3. Apoyo a grupos de investigación en consolidación a través de proyectos
Responsable