El pasado 12 de marzo la OMS declaró la alerta de pandemia por un nuevo tipo de coronavirus denominado SARS-CoV-2. Hasta el momento se han reportado más de 18 millones de casos, más de 700 mil muertes y un devastador costo para los más vulnerables: adultos de 65 años o más, personas con comorbilidades (hipertensión, diabetes, obesidad entre otras) y personas de bajos recursos [1]. A pesar de numerosos esfuerzos por encontrar formas de manejo exitoso del paciente con Covid-19 en estado crítico aún esto no ha sido posible, por lo que se necesitan con urgencia vacunas contra el SARS-CoV-2 que prevengan la infección, las complicaciones y muertes causadas por este virus. La respuesta de los linfocitos T CD4 y CD8 y linfocitos B que reconocen antígenos en los organismos patógenos es la base de la inmunidad celular y la producción de anticuerpos. Para que los linfocitos T respondan a una infección, secuencias cortas de aminoácidos de entre 9 y 25 residuos derivados de proteínas del patógeno deben ser procesados por las células presentadoras de antígeno y presentadas a los linfocitos T en moléculas del complejo mayor de histocompatibilidad clase I y clase II (MHC-I y MHC-II) [2]. Por su estructura química simple y bajo costo de producción, comparado con otros tipos de antígeno, los péptidos sintéticos deberían ser más utilizados en las vacunas, sin embargo, esto no se evidencia en el caso de las vacunas para SARS-CoV-2, que, en su mayoría, están basadas en virus atenuados, viriones y polipéptidos recombinantes. Hasta el momento, la implementación de péptidos sintéticos como antígeno para las vacunas ha sido limitada debido a la poca evidencia existente sobre su eficacia, no obstante, esta situación tiende a cambiar; péptidos de nueve aminoácidos han sido ampliamente utilizados por años como vacuna de la inmunoterapia del cáncer, y en pacientes con carcinoma de vulva su efectividad protectiva ha sida demostrada [3]. Adicionalmente, en los últimos años ha aumentado la evidencia del uso de vacunas basadas en neoantígenos tumorales utilizados para la inmunoterapia del cáncer [4-9]. Esta estrategia ha permitido establecer dos cosas (i) un péptido de 9 aminoácidos derivado de un antígeno tumoral mutado en solo un aminoácido (definición de neoantígeno tumoral) es suficiente para inducir inmunidad contra un tumor [6, 8] y (ii) cuando estas vacunas se administran de manera profiláctica en modelos de cáncer en animales, previenen el desarrollo del tumor [9]. Si bien identificar neoantígenos tumorales no es una tarea fácil, el desarrollo de herramientas de secuenciación de exoma y transcriptoma, las cuales analizan una gran cantidad de datos, ha permitido identificar mutaciones tumorales que están siendo traducidas, procesadas y presentadas eficientemente en moléculas MHC-I y MHC-II y utilizarlas como vacuna [10, 11]. Aprovechando estos desarrollos, en los últimos tres años, nuestro grupo ha implementado herramientas bioinformáticas y de inmunología útiles para la identificación de neoantígenos tumorales en pacientes con cáncer de mama, los cuales están siendo evaluados como vacuna en un ensayo clínico Fase I. Teniendo en cuenta la experiencia del grupo en la predicción de neoantígenos tumorales y los beneficios de los vacunas basadas en péptidos sintéticos, en este proyecto proponemos implementar el uso de plataformas bioinformáticas que hemos optimizado para la identificación de péptidos candidatos a una vacuna contra el SARS-CoV-2.