Esta propuesta aplica herramientas de biología cuantitativa, en la solución a protocolos básicos en el estudio del metabolismo de proteínas. Dentro del desarrollo de proyectos de investigación en bioprocesos, se destaca entre otras la captación de muestras sin afectar el sistema; desarrollo de medios de cultivo específicos para distintos organismos, ajuste de condiciones de separación de proteínas que aseguren la integridad de las mismas y homogenización de procedimientos, para incrementar la precisión en la cuantificación de especies biológicas y químicas. Este proyecto permite resolver preguntas relacionadas con el proceso de cuantificación de levaduras, en el proceso se ha encontrado variaciones en la medición de absorbancias con espectrofotómetro, el cual se ajusta para establecer los tiempos, en que el método de espectrofotometría permite la cuantificación de la levadura antes de ser afectado por la formación de micro y macroconidias. Aplica en el caso de la preparación de medios de cultivo para especies biológicas, el análisis bioinformático de filogenia, diversidad genética, caracterización biológica y fisiológica de los productos metabólicos de los organismos en estudio, que no cuentan con reportes bibliográficos específicos para su cultivo; la propuesta logra ajustar un medio de cultivo para sustentación y replicación de una bacteria metanogénica. También se ajustá protocolos base para la captación de muestras de proteínas sin afectar el sistema de cultivo y la separación de las mismas con base en centrifugación diferencial. Los datos bioinformáticos de especie biológica y química sientan las bases para el ajuste de los recipientes de cultivo de la levadura fusarium spp, el ajuste permité captación de muestras con la menor interferencia a las condiciones de operación del sistema, de esta manera se mantiene control sobre el balance de masa y cambios de temperatura. Las muestras obtenidas se separarán con ajuste del protocolo de centrifugación diferencial para después cuantificar su actividad y concentración. Con la presente propuesta se aplican métodos de biología cuantitativa para ajuste y desarrollo de protocolos de acuerdo a las necesidades específicas de investigación en bioprocesos también beneficia el crecimiento académico de los integrantes del Grupo de Investigación mejorando el pensamiento crítico, matemático y la capacidad de innovación.