Nuestro objetivo consiste en simular computacionalmente con base en un autómata celular, la comunicación sináptica entre neuronas vecinas; estudiando los dos elementos fundamentales involucrados, el procesamiento y la transmisión de la información. Para esto consideramos tanto la terminal presinaptica correspondiente a la neurona que envía la señal, la hendidura sináptica o sinapsis y la terminal postsinaptica correspondiente a la neurona receptora de información; establecemos el conjunto de elementos que se debe estudiar para calcular la entropía del sistema y a partir del análisis de las condiciones de equilibrio, parametrizamos los elementos físicos desde los cuales observamos la optimización del fenómeno de procesamiento y transmisión de información. Adicionalmente tenemos en cuenta la naturaleza química de estas sinapsis suponiendo que la información transmitida entre dos neuronas, se propaga por medio de sustancias mensajeras llamadas ”neurotransmisores”.