Proyectos
Combinación de estrategias moleculares con Química Click para detectar E. coli O157:H7
Resumen
La presente propuesta de investigación se centra en el desarrollo de una técnica basada en la biología molecular y la química Click, combinando la especificidad de los productos de amplificación de la PCR, con la bioortogonalidad que ofrecen las reacciones químicas basadas en reactivos Click. La implementación de PCR-Química Click, se proyecta hacia la detección de la bacteria enterohemorrágica Escherichia coli O157:H7, en alimentos contaminados, fundamentada en una reacción simple, específica, con pocos interferentes y que solo requiere de un PCR convencional y un lector de microplacas, equipos ya comunes dentro de los laboratorios de alimentos y muchos de diagnóstico clínico. Con la PCR-Química Click, se espera la implementación de una nueva estrategia para detectar, con alta fiabilidad y rapidez, muchas de las bacterias que ocasionan las intoxicaciones alimentarias más agresivas. La E. coli O157:H7 afecta seriamente la salud de los consumidores, en especial a la población infantil, los ancianos y los pacientes inmunosuprimidos, en los que puede causar diarreas hemorrágicas, anemia y falla renal aguda o crónica (Síndrome Urémico Hemolítico), vinculando la vida del afectado con una penosa dependencia de la diálisis, o llevándolo a la muerte. No hay tratamiento para este tipo de infección, porque es una bacteria que cuenta con varios factores de virulencia, entre estos las exotoxinas Shigas (Stx), que parecen estimularse con el empleo de antibióticos y antidiarreicos. Desafortunadamente, los métodos que pueden evidenciar la contaminación puntual, son costosos y por tanto, no se implementan de forma rutinaria en los laboratorios clínicos o de alimentos. Esta situación es el motivo por el cual la investigación gira alrededor del estudio y la implementación de PCR (por sus siglas en inglés Polymerase Chain Reaction)-Química Click, como una herramienta de diagnóstico particular de E. coli O157:H7. La investigación se desarrollará considerando los genes de las toxinas Shigas y del serogrupo O157 (stx1, stx2 y rfbO157), para identificar la bacteria; en la amplificación del ADN bacteriano, se empleará el reactivo click C8 alquino conjugado en el nucleótido dUTP. Luego, el amplificado será reconocido por una sonda captura, diseñada para este fin. La hibridación se revelará mediante la reacción click de cicloadición [3+2] entre el alquino de cada uno de los amplicones marcados y la azida; el producto Click 1,2,3-triazol, será el marcaje clave del reconocimiento específico de cada gen y se podrá medir y cuantificar a través de un sistema de revelado enzimático, muy similar al empleado en la técnica ELISA, pero sin el anticuerpo (biotina – estreptavidina – peroxidasa).
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:CONVOCATORIA PARA EL APOYO AL DESARROLLO DE TESIS DE POSGRADO DE LA UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA 2018, SEDE MEDELLÍN
Modalidad:Modalidad 1: Apoyo a tesis de doctorado en cualquier área del conocimiento
Responsable