En este estudio, se analizará la información de 54.241 Polimorfismos de Nucleótido Simple (SNPs) obtenidos a partir de una población de ovinos Pelibuey , en el Valle del Cauca que fueron genotipados previamente con el chip ovine SNP 50K de Illumina. Estos análisis serán usados para desarrollar un estudio de asociación genómica (GWAS) con cinco caracteres de crecimiento (Peso al nacimiento, Peso al destete, Peso al año, Ganancia Pre-destete y Ganancia Pos-destete), obtenidos previamente en un sistema de pastoreo en callejones de caña de azúcar. Inicialmente se realizará al conjunto de datos un control de calidad con el software Plink v.1.9, cuyos SNPs resultantes serán utilizados para realizar evaluaciones de desequilibrio de ligamiento. Posterior a esto, se realizará el estudio de asociación genómica GWAS, probando diferentes modelos tanto lineales, como mixtos. Para visualizar los resultados obtenidos en el GWAS se construirán gráficas Manhattan Plot y para el mapeo de los genes candidatos ubicados dentro o en los alrededores de cada región de interés se usarán las bases de datos de dominio público como National Center for Biotechnology Information (NCBI 2016) y Ensembl Genome Browser (Ensembl 2016). Se realizará la pertinente revisión de literatura, escritura del documento de tesis y del artículo científico, como se plantea en el cronograma de actividades, con el fin de obtener regiones existentes en algunos genes candidatos con funciones asociadas a la regulación del crecimiento en este tipo de ovinos. Estos resultados pueden ser incluidos en la evaluación genética de la raza y estudios de mejoramiento genético y programas de selección para estas variables productivas. |