Con la presente propuesta de investigación se busca implementar técnicas de transformación genética por recombinación, para mejorar la capacidad de las cepas S. cerevisiae y de levaduras no convencionales, con el fin de incrementar la producción de distintos metabolitos (etanol, isobutanol, xilitol, etc.) durante la fermentación mediante distintas técnicas de ingeniería genética, tales como, la deleción de genes involucrados con la formación de subproductos asociados a rutas metabólicas competitivas a la producción de esta sustancia. Adicionalmente, se plantea realizar modificaciones genéticas para habilitar a las levaduras para que asimilen pentosas durante la fermentación de hidrolizados lignocelulósicos. Por otro lado, por medio del análisis de biología de sistemas como la aplicación de herramientas ómicas y de modelamientos metabólicos se busca estudiar más detalladamente la fisiología de estas levaduras y así realizar más estudios en el mejoramiento de su producción.