Colombia ocupa una especial posición geográfica que ha generado una gran diversidad de habitats; esto ha favorecido los fenómenos de radiación adaptativa que lo hacen poseedor de una increible diversidad biológica. Para estudiar esta diversidad podemos recurrir a la biología evolutiva, ciencia que se ha caracterizado por la generación de conceptos que integran tópicos de muy diversas ramas del conocimiento. Esta es una poderosa herramienta que ha recibido un renovado interés e impulso, gracias a las técnicas moleculares con que contamos hoy, puesto que permite visualizar el pasado, presente y futuro de los procesos dinámicos de la evolución, y que hace aportes a través de la generación de modelos teóricos con implicaciones en estudios sobre la poblaciones de muchas especies sobre taxonomía, sistemática, ecología, evolución y conservación, entre otros. En un sentido amplio, la dinámica de las poblaciones actuales nos muestra su pasado histórico reciente, pero también revela el potencial evolutivo gracias al análisis de los niveles de variabilidad genética y a como están estructuradas genéticamente las poblaciones en estudio. De hecho se ha registrado al menos algun grado diferenciación genética entre las poblaciones dentro de las zonas geográficas debido a la estructura del hábitat, aislamiento por distancia y otros factores, generando en ciertas casos divergencias poblacionales de tal magnitud que están asociadas con el nivel de separación de las especies (Ehrlich y Raven, 1969; Wooten et al., 1988). Por otra parte, y dadas las características propias de cada especie, el conocimiento del organismo objeto de investigación influye definitivamente en las interpretaciones; es asi como las historias de vida y los factores ecológicos inciden sobre la estructura de las poblaciones (Loveless y Hamrick, 1984; Campos, 1996; Ruiz et al., 2002 ). Con este proyecto se busca incrementar el conocimiento de organismos que forman parte invaluable de nuestra cuantitativamente importante fauna: los cavidos, en sus formas silvestre y doméstica. Para estudiarlos se recurrirá a la aplicación de técnicas moleculares, específicamente loci microsatélites, en aras de dilucidar el tipo y grado de variabilidad genética de los individuos y poblaciones de las especies de cavidos colombianos, su estructura genética, así como establecer la relaciones filogenéticas entre ellas, y hacer recomendaciones para su manejo y conservación, lo que proporcionará una mejor valoración sobre la diversidad de estos grupos en Colombia. Adicionalmente es el aporte colombiano dentro de un gran proyecto de investigación que se adelanta actualmente a nivel de cavidos suramericanos, liderado por el profesor Spotorno de la Universidad de Chile.