Entre los componentes del rendimiento en grano del arroz, el hábito de ramificación de la panícula es un punto importante en la producción de granos de arroz (Yan et al., 1998), ya que está estrechamente relacionada con el potencial de rendimiento a través del macollaje de los brotes vegetativos y la ramificación del raquis de la panícula. En particular, la panícula es uno de los órganos más importantes debido a que su desarrollo regula directamente el número de granos. Debido a que los granos en la panícula se adjuntan al final de cada rama del raquis, se supone que su número es casi igual el número de ramas terminales. En consecuencia, el número de granos depende de la capacidad de ramificación de la panícula. Por lo tanto, la identificación de los factores genéticos que controlan los patrones de ramificación en la panícula es importante para mejorar el tamaño del vertedero de la panícula del arroz (Ikeda et al., 2010). Los rápidos avances en las tecnologías secuenciación de última generación NGS (del Inglés Next Generation Sequencing) en la última década han abierto nuevas oportunidades para explorar la relación entre el genotipo y el fenotipo con mayor resolución que nunca. Como el costo de la secuenciación se ha reducido, los mejoradores han comenzado a utilizar NGS con creciente regularidad para secuenciar grandes poblaciones de plantas, lo que aumenta la resolución de genes y locus de rasgos cuantitativos QTL (del Inglés Quantitative Trait Loci) lo que proporciona la base para el modelado de las relaciones complejas entre genotipo-fenotipo a nivel de todo el genoma (Varshney et al., 2014). El genotipado por secuenciación GBS (del Inglés Genotyping By Sequencing), es la más reciente aplicación para los protocolos de secuenciación de última generación cuyo propósito es el descubrimiento y genotipado de SNP (del Inglés Single Nucleotide Polymorphism) en una variedad de poblaciones y especies cultivadas. En el presente estudio se pretende mediante estas técnicas realizar un mapeo fino de los QTL que tienen influencia directa sobre el desarrollo y la arquitectura panicular en el arroz.