--Debido a las excelentes propiedades biofuncionales, químicas y en la salud se ha venido incrementando el interés por cultivar y consumir frutas a nivel mundial. Por ellos varios países, entre ellos Colombia, han presentado el mayor crecimiento en producción. Sin embargo, existen algunos problemas que limitan la producción y la exportación de las frutas, entre las que se encuentra la distribución del producto fresco, la baja calidad de la fruta, la perdida por enfermedades. Especies de Fusarium, Penicillum y Aspergillus son de los principales hongos que afectan los frutales, por lo que una correcta identificación mediante la caracterización morfológica y molecular permitiría tomar medidas de control, que faciliten su comercio a nivel nacional e internacional. Por ello, se pretende evaluar aislamientos de diferentes partes vegetales, provenientes de 35 especies de frutales, los cuales serán procesados y sembrados en caja Petri en medios de cultivo PDA. Posteriormente, serán identificados morfológica y molecularmente mediante la observación de la forma, pigmentación de la colonia, ausencia o presencia de estructuras reproductivas y el amplificado de las regiones ITS1 – ITS4 – IGS y (EF-1α) del ADNr. Con ello se espera, obtener un banco de aislamientos de especies de Fusarium, Penicilium y Aspergillus asociados a los frutales de importancia económica evaluados. De igual forma, una correcta y adecuada identificación morfológica y molecular de estas especies.