Las enfermedades virales en plantas son uno de los factores más limitantes de la producción agrícola. Para el caso de frutales andinos como el tomate de árbol (Solanum betaceum), algunos de los efectos que inducen las virosis incluyen la disminución en los rendimientos de los cultivos, la reducción de su longevidad y el detrimento de las características cosméticas y organolépticas de los frutos, con la consiguiente reducción de su valor comercial. El manejo integrado de enfermedades virales se fundamenta en la realización de prácticas preventivas como la siembra de material certificado por su sanidad, la detección prematura de focos de infección, el control de poblaciones de vectores y la realización de prácticas culturales; todo esto enmarcado en la posibilidad de disponer de germoplasma resistente y de contar con métodos de detección asintomática altamente sensibles, específicos y de rápida ejecución. Para el desarrollo de dichos métodos de detección, es fundamental el conocimiento previo del viroma (Ej. la sumatoria de virus que afectan una especie vegetal bajo determinadas condiciones agroecológicas) y la disponibilidad de herramientas técnicas y bioinformáticas que permitan diseñar pruebas de diagnóstico que cumplan con estándares internacionales. Un aspecto que ha impedido un mejor conocimiento de los viromas vegetales en nuestros países, es la necesidad de disponer de cebadores, sondas y anticuerpos específicos para detectar mediante pruebas moleculares (Ej. RT-PCR, dot-blot) o serológicas (Ej. IMI, ELISA) las variantes virales presentes en las diferentes regiones de cultivo. En este TDG se pretenden identificar los componentes del viroma de plantas de tomate de árbol con síntomas de virosis en Antioquia, como base para el desarrollo de pruebas de detección de RT-PCR en tiempo real (qRT-PCR) ajustadas a los genotipos de las variantes predominantes en este hospedante vegetal. Para esto se adelantará la secuenciación masiva del transcriptoma de un bulk de muestras de tejido foliar de plantas de tomate de árbol procedentes de diferentes localidades de Antioquia, utilizando el sistema Hi-Seq 2000 de illumina y diferentes análisis bioinformáticos tendientes a caracterizar los genomas virales y sus niveles de variación intraespecífica.