La digestión anaerobia es un proceso complejo, multi-etapa que involucra procesos físicos, bioquímicos y de dinámica de fluidos. Es un proceso de conversión biológica en el cual los microorganismos transforman la materia orgánica en una mezcla gaseosa compuesta principalmente de metano y dióxido de carbono y un lodo rico en nitrógeno y otros nutrientes a través de acción concertada de comunidades de bacterias (Wu 2012). El objetivo principal de una digestión anaerobia es la estabilización de la materia orgánica y, adicionalmente, la reducción de olores, concentración de patógenos y la cantidad de material orgánico sólido. En el proceso se incluye una serie de procesos bioquímicos por parte de diferentes microorganismos para degradar la materia orgánica bajo condiciones anaerobias.