La cadena ovino-caprina en Colombia, se caracteriza por una producción, acopio, transformación y comercialización de tipo informal, en la mayoría de los eslabones. La problemática que afronta el sector está relacionada con altos niveles de consanguinidad, ausencia de programas de selección y control reproductivo, problemas sanitarios, ausencia de sitios especializados para el sacrificio de las ovejas, escasa definición de políticas gubernamentales, poca investigación, poco desarrollo tecnológico y empresarial, sistemas de producción extensivos, sin definición de objetivos, sin control productivo, baja productividad y desconocimiento de la calidad de los productos obtenidos (Grajales y Tovío, 2010). Aunque la población ovina ha sido fluctuante en alrededor de dos millones de cabezas desde el 2005, sin embargo, el reducido y el sustitutivo consumo aparente de carne ovina, desde el mismo año, ha ganado terreno en el mercado interno, creciendo a una tasa promedio marginal del orden del 1,5 % (Arévalo y Correa, 2013). La población de ovinos de pelo se encuentra en zonas de trópico bajo y medio y en algunos casos, asociada a producciones bovinas o de cultivos permanentes, siendo usados principalmente como fuente económica de proteína. En el Valle del Cauca se ha incrementado la producción ovina, especialmente para control de arvenses en los cultivos de caña de azúcar. Mediante los avances de la genética molecular y la genómica es posible detectar genes asociados a características de interés económico. La Selección Asistida por Genes (SAG), se considera una herramienta importante dentro de los programas de mejoramiento animal tradicionales, la cual permite identificar mutaciones funcionales dentro de los genes e identificar regiones cromosómicas asociadas a características de importancia zootécnica. En ovinos se han detectado un numeroso conjunto de SNPs (Single Nucleotide Polimorphisms) que pueden servir como genes candidatos para mejorar caracteres de crecimiento muscular y la calidad de la canal y de la carne. El presente proyecto busca contribuir al conocimiento de aspectos relacionados con la productividad y competitividad de la cadena cárnica ovina, mediante selección asistida por genes, en caracteres de crecimiento muscular y la calidad de la canal y la carne, con el de fin seleccionar animales con mejores características de calidad. Se generará información de caracteres de crecimiento muscular por ultrasonido y caracteres de la calidad de la canal y de la carne, que serán asociados con un conjunto de mínimo 50 SNPs en cada uno de los genes Calpaína (CAPN1), hormona del apetito Leptina (LEP), hormona de crecimiento y receptor del desarrollo corporal (GH y GHR), Calpastatina (CAST), factor de crecimiento insulínico (IGF1), Miostatina o factor de diferenciación del crecimiento (GDF8), proteína 9 de unión a los ácidos grasos (FABP9) y Proteína 4 de unión a ácidos grasos (FABP4), mediante un microarray, con el fin de implementar un programa de Selección Asistida por Genes (SAG). La propuesta se llevará a cabo en la Reserva Natural El Hatico, situada en Cerrito (Valle del Cauca), con la participación de los grupos de investigación Recursos Zoogenéticos y Genética Molecular Animal de la Universidad Nacional de Colombia-Sedes Palmira y Bogotá quienes han estado trabajando en el proyecto Hermes 12658 “Herramientas para el fortalecimiento de los grupos intersedes Genética Molecular Animal y Recursos Zoogenéticos Palmira, mediante el desarrollo de la caracterización de genes asociados a fenotipos de calidad de la carne, en razas bovinas criollas”. También participará el grupo Manejo y agroindustrialización de productos de origen biológico de la Facultad de Ingeniería y Administración, tres investigadores de la Fundación Centro para la Investigación en Sistemas Sostenibles de Producción Agropecuaria–Cipav y un candidato a grado en Doctorado en Ciencias Agropecuarias, con alta experiencia en Bioinformática.