Hongos y bacterias fitopatógenos son limitantes en la producción de cultivos. El manejo tradicional de estos problemas ha generado costos ambientales debido al uso de fungicidas y bactericidas de origen sintético. Una alternativa de manejo sostenible es el uso de extractos vegetales con propiedades antimicrobiales. Capsicum spp ha sido reportado como un biofungicida y un biobactericida. Sin embargo hay poca literatura sobre genotipos de Capsicum spp usados como biocontroladores. El programa de mejoramiento genético de la resistencia de aji y pimentón a enfermedades ha generado diferentes líneas recombinantes con resistencia a patógenos. Adicionalmente en este proceso se ha observado que algunas de estas líneas poseen propiedades excepcionales para ser usadas en el manejo de enfermedades en cultivos. Con tal fin se evaluaran extractos de frutos de diez genotipos de Capsicum spp seleccionados previamente en el invernadero de la Universidad Nacional de Colombia sede Palmira como germoplasma elite por sus propiedades antimicrobiales. Se harán extractos de los frutos y se probaran In vitro e In vivo en cinco patosistemas: Phaeoisariosis griseola- Phaseolus vulgaris; Erwinia carotovora spp ¿ Capsicum spp; Fragaria Vesca- Botrytis cinérea; Rhizoctonia solani,- Phaseolus vulgaris; Colletrotrichum spp- Mangifera indica. Para los experimentos In vitro se evaluara el crecimiento de los cinco patógenos en medios de cultivo artificial conteniendo diferentes dosis de extracto de los diez genotipos de Capsicum spp seleccionados. Se escogerán los extractos con mayor poder antimicrobial y la mejor concentración de control. Para los experimentos In vivo se sembraran en potes plantas de Phaseolus vulgaris y Capsicum spp y se usaran igualmente frutos de Mangifera indica y Fragaria vesca L; Las plantas y los frutos serán asperjados con los extracto seleccionado en el experimento In vivo y se usara la dosis más eficiente registrada. Posteriormente se inocularan con su respectivo patógeno y se evaluara la severidad en la planta. Se seleccionara los extractos más eficiente In vivo para su recomendación en pruebas de campo.