La mayoría de las especies de frutales tropicales presentan problemas relacionados con la uniformidad de germinación del stand de plántulas o de las semillas para su establecimiento. Esta situación refleja una desuniformidad asociada a diferentes niveles de madurez de las semillas provenientes de un mismo fruto lo que causa diferentes respuestas en germinación de los lotes de semillas y vigor de las plántulas que originan que causan retrasos en el establecimiento del cultivo y por consiguiente en el rendimiento de fruta con serios efectos en la competitividad de los agricultores a nivel nacional e internacional. Otro aspecto de importancia es la presencia de latencia de las semillas, fenómeno muy importante en la distribución espacial y en el tiempo de especies con bajos niveles de domesticación pero que en el caso de las especies cultivadas resulta inconveniente en los sistemas de producción que demandan cultivos uniformes que faciliten el manejo agronómico que apunte a optimizar los recursos para un máximo rendimiento del cultivo. Los diferentes tipos de latencia (exógena, endógena o combinaciones) requieren ser estudiados con el fin de proponer soluciones prácticas a nivel de semilla comercial. Muchas semillas presentan latencia, por condiciones como: presencia de una testa dura que el embrión no puede romper, testa impermeable que impide la entrada del agua y del aire al embrión, embrión rudimentario o no totalmente formado, embrión fisiológicamente inmaduro, o presencia de inhibidores en la testa o en el endospermo que impiden el desarrollo inicial del embrión. Cuando la latencia se debe a condiciones de la testa se interrumpe en el momento en que esta se daña o se rompe por acciones mecánicas, químicas y térmicas. Cuando se debe a factores asociados al embrión, se requiere de tratamientos con fitohormonas, térmicos o de tiempo de almacenamiento como en el caso de embriones rudimentarios o inmaduros. Otro aspecto importante de la condición fisiológica de la semilla es su tolerancia a la desecación y bajas temperaturas lo que permite desde el punto de vista del almacenamiento la clasificación de las semillas en ortodoxas (toleran), recalcitrantes (no toleran) e intermedias. Existe metodología establecida para abordar esta condición que incluye curvas de desecación, pruebas viabilidad de las semillas, pruebas de germinación y pruebas de vigor. Esta información resulta de especial interés para los agricultores que seleccionan su propia semilla a partir del cultivo comercial. Por otro lado, es importante conocer las condiciones óptimas para la germinación de una especie determinada cuando se evalúa los efectos del almacenamiento, ya que los resultados obtenidos podrían deberse a las diferencias en los métodos de evaluación de la calidad fisiológica, antes que a los efectos del almacenamiento. Si no existen protocolos para evaluar la calidad fisiológica de una especie determinada, como en el caso especies de frutales tropicales, es indispensable definir las condiciones que permiten una mayor expresión de las variables de calidad fisiológica (porcentaje de germinación y viabilidad). --