El funcionamiento de los ecosistemas se encuentra sostenido por la biodiversidad. Los servicios que prestan los ecosistemas sanos son, a su vez, el fundamento del bienestar de las personas. Por lo que en los últimos años ha habido un interés y una necesidad creciente por emplear índices ecológicos robustos para evaluar el estado y condición de los ecosistemas en los ambientes marinos. Las aguas de la Bahía de Tumaco están afectadas por actividades humanas que producen enriquecimiento orgánico. La presente investigación evalúa la condición de las comunidades bentónicas, gracias a que ellas describen las presiones acumuladas que afectan al ecosistema. Se valoraran indicadores de estado a través de la determinación de nutrientes, concentración de oxígeno; clorofila a; materia orgánica. La respuesta ecológica será evaluada en la comunidad bentónica, estableciendo su estructura y función. Posteriormente, la distribución de la abundancia de cada una de las especies encontradas, será clasificada en cinco categorías ecológicas (sensibles a contaminación, indiferente, tolerante y especies oportunísticas de primer y segundo orden). Finalmente, La abundancia de estas categorías ecológicas se relacionará con las variables ambientales usando métodos de ordenación multivariada para estimar la salud de la comunidad bentónica de la Bahía de Tumaco. Se espera que las especies sensibles a contaminación se encuentren en sitios donde la calidad del agua y sedimento sea buena (altos niveles de oxígeno, bajas concentraciones de nutrientes, de clorofila, poca materia orgánica y bajos niveles de metales); mientras que las taxa oportunísticas estén en sitios donde el oxígeno sea bajo, la concentración de nutrientes y la materia orgánica en el sedimento.