La pudrición basal del fruto se constituye como una de las enfermedades más limitantes del cultivo de Selenicereus megalanthus en Colombia, esta enfermedad puede generar pérdidas de la fruta exportable superiores al 80% en el Valle del Cauca y Cundinamarca, debido a la poca investigación fitopatológica y el empleo de fungicidas de alto espectro y categorías toxicológicas altas, que representan cerca del 50% de los costos de producción por ciclo, además los agentes causales no han sido reportados oficialmente. El objetivo de la presente investigación será caracterizar la sintomatología de la pudrición basal y realizar aislamientos secuenciales de los posibles agentes causales. Se realizarán encuestas a cultivadores para conocer la frecuencia de aparición de las enfermedades. Se colectarán muestras en Quindío y en el Banco de Germoplasma de la Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira, a las cuales se les realizará un diagnóstico y descripción de la sintomatología de la pudrición basal del fruto. Las muestras se procesarán en cámara húmeda y se aislarán los organismos en PDA a cultivo puro. Se reporta la pudrición basal como la enfermedad más frecuente en el 35% de los encuestados con una incidencia de la enfermedad en la cosecha del 24%. La descripción sintomatológica presenta dos tipos de características y se relaciona la presencia de un insecto asociado a una sintomatología, lo cual puede definir esta diferencia, sin embargo debe realizarse la pruebas de patogenicidad para validar los organismos aislados.