Colombia esta sembrando ají (Capsicum) para exportar en los departamentos de Magdalena, Valle del Cauca, Sucre, Bolívar, La Guajira, Córdoba y Cauca, en pequeña cantidad para mercados de Estados Unidos y México. Magdalena es el principal departamento productor seguido del Valle del Cauca, pero es el Valle del Cauca el que posee los más altos rendimientos por hectárea. Lo cual a convertido este cultivo en una importante fuente de ingresos para pequeños agricultores, al igual que una fuente de empleo debido a la gran mano de obra que requiere este cultivo durante la época de cosecha. Debido al incremente de las áreas cultivadas con ají y pimentón, también algunas enfermedades de importancia para este cultivo han empezado a causar perdidas hasta del 100% de la producción. Entre estas enfermedades se encuentra las pudriciones causadas por Phytophthora capsici un oomiceto de gran importancia económica ya que afecta virtualmente cualquier parte de la planta de ají y pimentón. De ahí la necesidad de conocer más este patógeno en cuanto a las fuentes de resistencia que existen en el banco de germoplasma de ají y pimentón de la Universidad Nacional de Colombia , sede Palmira y la forma como se hereda esta resistencia para hacer más eficiente el programa de mejoramiento de hortalizas. Por otro lado es necesario conocer la variación genética, y patogénica de los aislamientos que se han obtenido en las diferentes sitios donde se cultiva ají y pimentón en el Valle del Cauca. Por medio de la técnica PCR usando los primers específicos PCAP (5′-TCCTCCGCTTATTGATATGC), y el ITS primer ITS5 (5′GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG) se realizarà una amplificación, que posteriormente será digerida con la enzima MspI la cual genera cuatro fragmentos de , 219, 194, 140pb específicos para la especie Phytophthora capsici. Para la caracterización molecular 100ng de ADN será el material usado para la reacción de restricción y ligamiento, preamplificación preselectiva, y amplificación selectiva usando la reacción en cadena de la polimerasa PCR, secuencias de adaptadores, secuencias de primers son proporcionados por el Kit de AFLP Microbial Fingerprinting (Perkin – Elmer crop). Los fragmentos de AFLP serán leídos manualmente como presencia o ausencia de la banda en el perfil de cada aislamiento, y una matriz binaria será construida. Para evaluar la patogenicidad de los aislamientos se realizara el método de inoculación por decapitación. Se realizara una siembra en bandejas de 24 alvéolos, con 4 repeticiones y 6 plantas por repetición. Las plantas usadas para la inoculación deben estar en estado fenologico de floración y lo más homogéneas posibles, y se evaluaran cada tres días hasta el día 21, las medidas de las respectivos avances de la enfermedad a traves del tallo para cada uno de los intervalos de tiempo se mediran en centímetros (cm) y con una apreciación de .El diseño estadístico a utilizar será Bloques Completos al Azar. El análisis de los datos se realizara por medio del análisis de varianza ANDVA y la prueba de promedios de DUNCAN. Para estudiar la reacción de resistente de las introducciones PI188476, PI201227, PI267731, PI431499, Grif 9334, A 3, PI496197, se dispondrá de tres cepas de P. capsici, con alta, media y baja patogenicidad El método de inoculación a emplear será por decaputaciòn por su posibilidad de cuantificación. ). El diseño corresponde con Parcelas divididas, donde la parcela principal serán las cepas y en la subparcela estarán las accesiones que son el factor que se quiere analizar con mayor presiciòn, y se evaluaran cada tres días hasta el día 21, las medidas de las respectivos avances de la enfermedad a traves del tallo se mediran en centímetros (cm). El análisis de los datos se realizara por medio del análisis de varianza ANDVA y la prueba de promedios de DUNCAN. Para conocer la forma como se hereda la resistencia a Phytophthora capsici en aj y pimenton se emplearàn los cruzamientos obtenidos en trabajos previos de la F1, F2 F3, RC1, Y RC2. Empleado el aislamiento màs patogénico se realizarà la inoculación por el método de decapitación. El diseño a emplear será Bloques completos al Azar, los parentales y la F1 tendrán igual número de plantas 50 por repetición ubicadas en bandejas de 24 alvéolos. Para la F2, y F3 el número de plántulas a evaluar dependerá del número de semillas de las que se disponga. Para el análisis genético se realizarán tablas de frecuencias esperadas y observadas, utilizando el programa SAS versión 8.2 (TS2MO) bajo la plataforma SunoS 5.8.