La antracnosis (Colletrotrichum lindemuthianum) y la ascochyta (Phoma exigua var. diversispora), son consideradas las enfermedades más limitantes para el desarrollo del cultivo de fríjol en Colombia, ocasionando pérdidas económicas del 95% y el 74% y desestimulando la siembra por los altos costos de producción, que implica el control químico de estas enfermedades. Esta situación ha hecho que a pesar de que Colombia es un país con riqueza en variabilidad genética de fríjol, con cultura de producción y adaptación del cultivo a variados ambientes, presente déficit en la oferta para suplir el mercado interno, por lo que se tiene que importar grano para poder cubrir la demanda nacional . La resistencia genética es la estrategia de manejo más eficiente para este tipo de enfermedades. El grupo de mejoramiento de leguminosas de la Universidad Nacional y el CIAT, ha introducido genes de resistencia a antracnosis en variedades Colombianas de fríjol tipo Bola roja y Rojo moteado, que son ampliamente aceptadas por agricultores y consumidores, pero son altamente susceptibles. El proceso de introgresión fue rápido y confiable utilizando selección asistida por marcadores moleculares (SAM). Esta herramienta ha permitido obtener muy buenos resultados, aunque la eficiencia en el proceso de selección, podría aumentarse ubicando nuevos marcadores asociados a la resistencia. Para el caso de la ascohyta, la información sobre estrategias de manejo es muy limitada, aunque han sido reportadas algunas fuentes de resistencia dentro del banco de germoplasma del CIAT, estas accesiones, aún no han sido empleadas en programas de mejoramiento en Colombia. Sin embargo, podrían utilizarse como parentales resistentes, para la obtención de fríjoles tipo Bola roja y Rojo moteado con resistencia. La selección de individuos resistentes, donde se logra introgresar los genes de interés, podría acelerarse identificando marcadores moleculares asociados a la resistencia. Esto haría posible la piramidación de genes de resistencia a ascochyta y a antracnosis en poblaciones mejoradas de fríjoles Andinos. Este trabajo sería la primera investigación que se hace en el país, que busca generar una estrategia para el manejo de la ascochyta, basado en resistencia genética. Esto permitiría hacer un aporte a la solución de la problemática expuesta, iniciando un programa de mejoramiento encaminado a la obtención de variedades de fríjol con resistencia a ascochyta y apoyar el programa de mejoramiento a antracnosis, dirigido hacia las zonas productoras de Cundinamarca y Boyacá.