Las áreas marinas protegidas (AMP’s) por lo general se han diseñado y manejado priorizando la protección de componentes “estructurales” como hábitats específicos o de especies, y prescindiendo de los componentes “funcionales”, como el movimiento de los organismos y el flujo de la materia. Estudios realizados en el Caribe acerca de la estructura de la comunidad íctica y de invertebrados de importancia comercial, en manglares, praderas de pastos marinos o arrecifes coralinos, suelen mencionar que esos biotopos funcionan como áreas de cría para varias especies que luego residen en el arrecife. Este vínculo funcional entre hábitats es considerado un paradigma ecológico, y se ha sugerido que antes de continuar desarrollando planes de manejo, se requiere una mejor comprensión de la conectividad sobre los hábitats y recursos aprovechados por diferentes especies durante su ciclo de vida. Esta investigación, en conectividad ecosistémica, pretende dar inicio a estudiar los enlaces ecológicos entre manglares, pastos y arrecifes de coral en San Andrés isla y parte en los cayos del sur (Reserva de Biosfera Seaflower), para reconocer y cuantificar la relevancia de la interacción entre estos ecosistemas respecto a los recursos vitales (naturales) a nivel local. Para lo cual se determinará cuáles especies ícticas dependen críticamente de manglares y praderas durante su ontogenia. Se seleccionarán sitios donde confluyan simultáneamente manglares, pastos marinos y arrecifes de coral, y sitios donde los arrecifes estén relativamente separados de los otros dos biotopos, y mediante censos visuales diurnos (SCUBA y snorkeling), aplicando transeptos de banda, se evaluará la composición, densidad y estado de desarrollo de peces arrecifales de importancia ecológica y económica en la temporada de lluvia y de sequía en cada biotopo mencionado. Se determinará la abundancia y riqueza de las especies, y mediante ANOVAS se compararan estas variables respecto a juveniles y adultos, y entre hábitats en cada sitio. Así mismo en el caso de la langosta espinosa, se tomará muestras en hábitats al azar y de la pesca artesanal, y se explorará parte del estado del stock de acuerdo con la variación fenotípica según su origen geográfico, sexo y estado de desarrollo (juvenil y adulto); para lo cual se utilizarán herramientas de la Morfometría Geométrica. Posteriormente, se harán correlaciones mediante regresiones lineales, de las anteriores variables con algunos atributos estructurales de los ecosistemas y los hábitats, y mediante coeficientes de similaridad, se examinará la relación de la estructura comunitaria íctica entre hábitats. Se espera que los resultados de esta investigación contribuyan a la teoría ecológica, y permitan aportar medidas de manejo y conservación, en especial sobre la zonación actual de las AMP de San Andrés y los cayos del sur, según el criterio de conectividad; con beneficio para el sector pesquero, turístico, y de la integridad de los pobladores y de los ecosistemas.