En un cuarto limpio es importante lograr el control simultáneo de la temperatura, la humedad y la presión diferencial. El acoplamiento entre estas variables hace complejo el problema de control. Por ejemplo, cuando se logra el control de la diferencial de presión, se afectan los otros parámetros: temperatura y humedad. En el presente trabajo se sintetiza un modelo dinámico de un sistema de aire acondicionado con base en trabajos similares desarrolados anteriormente. Sin el ánimo de perder generalidad, el modelo propuesto se ajusta a una aplicación práctica: una Sala de Cirugía. Luego de establecer ciertas consideraciones para el ajuste del modelo, este es linealizado con respecto al punto de operación y es implementada la técnica de control multivariable LQG. Con el controlador LQG es posible lograr los objetivos de control anteriormente propuestos. La simulación del modelo matemático del sistema de aire acondicionado controlado nos permite establecer qué es necesario considerar en el diseño del sistema físico real. El estudio de las señales de control nos ayuda a dimensionar el sistema de aire acondicionado de acuerdo a cambios en los objetivos de control. Con la intención de comparar las tecnicas de control multivariables con el control descentralizado, se desacopla el sistema y se explora la sintonia de controladores PI sintonizados secuencialmente utilizando el método Relay Feedback, BLT, y técnicas con Lógica difusa. Ninguno de los anteriores muestra un mejor desempeño que el multivariable.