Las enfermedades virales de las plantas son uno de los factores más limitantes de la producción agrícola en el mundo. Para el caso de los frutales, algunos de los efectos más evidentes incluyen la disminución en los rendimientos de los cultivos y de su longevidad, la reducción en la floración y el deterioro de las características organolépticas de los frutos con la consecuente reducción de su valor comercial. En las regiones andinas de Colombia se cultivan diferentes frutales con gran potencial para consumo interno, debido a sus excelentes características nutritivas (ej. vitaminas, antioxidantes, oligoelementos, etc) y para exportación, por su condición de productos exóticos; destacándose la uchuva (Physalis peruviana) y la gulupa (Passiflora edulis f. edulis). Desafortunadamente, dichos cultivos son muy susceptibles a enfermedades de orígen viral que ocasionan síndromes devastadores, y que dado el desconocimiento de su etiología específica, son inadecuadamente manejadas por parte de los agricultores del país. En este proyecto se plantea la utilización de metodologías moleculares para avanzar en el conocimiento de las características biológicas de los virus que afectan dichas plantas en el departamento de Antioquia y para el diseño de pruebas de diagnóstico que fortalezcan los programas de mejoramiento genético, vigilancia cuarentenaria y certificación de material de siembra. Para esto se emplearán métodos de secuenciación de nueva generación (NGS) en asocio con herramientas bioinformáticas que permitan determinar los viromas de RNA asociados a dichos frutales en dos regiones de Antioquia: Suroeste y Oriente. Dichos análisis facilitarán no sólo la identificación de las especies de virus, sino también la estimación de su abundancia relativa, niveles de variación y afinidad filogenética con taxa virales conocidos. Las secuencias obtenidas servirán de base para el diseño de primers para su utilización en pruebas de diagnóstico molecular tipo RT-PCR convencional y en tiempo real (RT-qPCR). La ejecución del proyecto permitirá además, la realización parcial de una tesis de maestría, dos TDG de pregrado y el establecimiento de un semillero de investigación con tres estudiantes de pregrado.