El mejoramiento genético, haciendo uso de la selección asistida por marcadores genéticos (SAM), es una estrategia para mejorar la producción y calidad de la leche. Una de las características a mejorar es la composición de ácidos grasos, dada su importancia para evaluar la calidad nutricional de esta. Recientemente se ha sugerido que el estudio de genes candidatos asociados a este carácter, puede contribuir a obtener producciones lácteas de mayor valor nutricional, siendo la enzima Steaoryl Coa Desaturasa (SCD) uno de estos genes, ya que interviene en la síntesis de ácidos grasos y se ha determinado que existen polimorfismos. El objetivo de este proyecto es determinar las frecuencias alélicas y genotípicas del gen de la SCD y estimar algunos parámetros de diversidad y estructura genética en una población de ganado Holstein en el departamento de Antioquia. Es estudio se realizará con 200 vacas Holstein en diez lecherías especializadas ubicadas en los municipios de San Pedro, Santa Rosa de Osos, Don Matías, la Unión y Medellín (corregimiento de Santa Elena). El DNA se extraerá por el método de "salting out" y la genotipificación se realizará usando la técnica ACRS (amplification created restriction sites - ACRS), combinada con el empleo de PCR (reacción en cadena de la polimerasa). El equilibrio de Hardy Weinberg, se analizará usando una prueba análoga al test exacto de Fisher, así mismo la estructura genética entre las poblaciones se calculará mediante los estadísticos F de Wright. Se espera obtener información sobre las frecuencias genotípicas, alélicas y el flujo de genes entre poblaciones, lo que permitirá determinar su grado de diversidad y diferenciación; además de determinar la importancia del gen SCD en un programa de mejoramiento genético. Este trabajo contribuirá a la estructuración de un programa de selección asistida por marcadores moleculares.