La agroindustria hortícola es un sector estratégico en el mercado global, esencialmente porque las tendencias de consumo están reconociendo cada vez más el aporte que las hortalizas tienen en la nutrición y la salud de la población. El género Capsicum se encuentra entre los productos hortícolas de mayor importancia Nacional e internacional, no solo como fuente de alimento sino también económicamente, dada su rentabilidad, productos y alta demanda de mano de obra (Agenda Prospectiva de Investigación y Desarrollo Tecnológico para la Cadena de Hortalizas en Colombia salsa de ají, 2010). Aunque los rendimientos para la zona agroecológica del Valle del Cauca son óptimos, comparados con los de otras zonas productoras, estos se ven afectados, disminuyendo su rentabilidad, debido a la susceptibilidad que presenta al ataque de plagas y a la presencia de agentes fitopatógenos, entre los cuales esta Phytophthora capsici como la enfermedad más grave y específica a la vez y el virus PepDMV (Virus del Mosaico Deformante del Pimentón), que causan severas perdidas en los cultivos de ají y pimentón. El compromiso con los agricultores, comercializadores y consumidores, es ofrecer materiales resistentes a virus PepDMV y a P. capsici adaptados a nuestras regiones, debido a que estos dos fitopatógenos no responden al tratamiento químico. Esto indica la necesidad de evaluar e identificar materiales resistentes a las dos enfermedades para utilizarlos en programas de mejoramiento genético.