Existen en la naturaleza seres vivos que desarrollan estructuras fotónicas, las cuales son responsables de efectos de iridiscencia en alas de aves y caparazones de escarabajos. Para comprender la naturaleza de estas estructuras se ha hecho un tratamiento similar al de materiales semiconductores, basados en el modelo de estudio de estructuras periódicas [1,2]. Sin embargo, el desorden en materiales fotónicos pueden producir una mayor complejidad y dar lugar a un número de sorprendente efectos, los cuales se puede encontrar en el campo de la óptica de los cuasi cristales fotónicos [3]. En los materiales fotónicos luego del análisis de imágenes obtenidas por medio de microscopia electrónica de barrido es perceptible el hecho de que son materiales amorfos, y por tanto merecen un tratamiento que considere el desorden inherente en sus estructura para obtener más información del sistemas y de esta manera poder explicar sus propiedades físicas, en particular, cuales originan el comportamiento óptico que exhiben, es decir, la iridiscencia. Por tanto, planteamos el desarrollo de un trabajo teórico en vía de comprender, analizar y describir los efectos que el desorden y el cuasi-desorden tienen en las propiedades ópticas de los materiales fotónicos, por medio de un estudio basado en la matriz de transferencia.