Proyectos
ANÁLISIS GENÓMICO AL ASOCIADO AL pH, LA CAPACIDAD DE RETENCION DE AGUA (CRA) Y EL COLOR EN CINCO MUSCULOS DE LA PIERNA DE OVINOS PELIBUEY EN EL VALLE DEL CAUCA
Resumen
En Colombia, la carne ovina es un producto con oportunidades de mercadeo y con posibilidad de exportación a mediano y largo plazo, pero existe escasa información sobre las características de calidad de la carne, por lo cual se realizaron evaluaciones de pH, CRA y Color en los músculos de la pierna Semimembranoso (S), glúteo medio (GM), bíceps femoris (BF), cuádriceps femoral (CF) y Psoas menor (SM). Se utilizaron 38 machos de 35 Kg y 14 meses de edad en promedio, con dos repeticiones por tratamiento. El ANOVA del pH fue altamente significativo (p<0.0001) con promedio 5.98 ± 0.18, la CRA no mostro diferencias significativas entre músculos, con una media de 50.27%, se observo diferencias significativas en los índices de color (p<0.05) de la metodología CIEL (1976), con promedios de 11.68 en (a), 13.09 (b) y 34.34 (L). Estos datos fueron obtenidos mediante Proyecto HERMES 37701 "EVALUACIÓN DEL PATRÓN RACIAL, EL CRECIMIENTO MUSCULAR Y LA CALIDAD DE LA CANAL Y DE LA CARNE EN UNA POBLACIÓN DE OVINOS PELIBUEY EN EL VALLE DEL CAUCA". Por otro lado, en el proyecto HERMES 25004 "ANÁLISIS GENÓMICO DE POBLACIONES OVINAS MEDIANTE EL USO DE UN MICROARREGLO DE ALTA DENSIDAD ASOCIADO A CARACTERÍSTICAS DE CRECIMIENTO Y CALIDAD DE LA CARNE, CON UNA APROXIMACIÓN A UN SISTEMA DE CLASIFICACIÓN DE CANALES", financiado por COLCIENCIAS, obtuvieron los genotipos de 50.000 SNPS para los mismos individuos. El presente proyecto busca utilizar la información generada en dichos proyectos para realizar un análisis genómico entre las características de la calidad de la carne (pH, CRA y COLOR) y 54.241 Polimorfismos de Nucleótido Simple SNPs Polimorphism). Los animales fueron criados previamente en un sistema de pastoreo en callejones de caña de azúcar. Inicialmente se realizará al conjunto de datos un control de calidad con el software Plink v.1.9, cuyos SNPs resultantes serán utilizados para realizar evaluaciones de desequilibrio de ligamiento. Posterior a esto, se realizará el estudio de asociación genómica GWAS, probando diferentes modelos tanto lineales, como mixtos. Para visualizar los resultados obtenidos en el GWAS se construirán gráficas Manhattan Plot y para el mapeo de los genes candidatos ubicados dentro o en los alrededores de cada región de interés. Se usarán las bases de datos de dominio público como National Center for Biotechnology Information (NCBI 2016) y Ensembl Genome Browser (Ensembl 2016). Se realizará la pertinente revisión de literatura, escritura de los documento de tesis, con el fin de obtener regiones existentes en algunos genes candidatos con funciones asociadas a la calidad de la carne en este tipo de ovinos. Estos resultados pueden ser incluidos en la evaluación genética de la raza y estudios de mejoramiento genético y programas de selección para estas variables productivas.
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:Convocatoria de apoyo a estudiantes de pregrado y posgrado para el fortalecimiento de la investigación e innovación de la Universidad Nacional de Colombia Sede Palmira 2020-2021
Modalidad:Estímulo a estudiantes de pregrado
Responsable