Proyectos
Detección molecular de virus de RNA en tejido foliar y semillas de tomate en Antioquia mediante RT-qPCR y LAMP
Resumen
En este proyecto se pretende evaluar la utilidad de la novedosa técnica isotérmica de LAMP para la detección de virus de RNA en tejido foliar y semillas de tomate procedentes de Antioquia, con el fin de cerrar la brecha de conocimiento que se tiene en la actualidad sobre los principales limitantes fitopatológicos que afectan la producción agronómica de esta hortaliza en el país. Aunque inicialmente para la detección e identificación de los virus se utilizará una batería de metodologías convencionales de virología vegetal que incluyen extracción de dsRNA, PCR convencional, RT-PCR en tiempo real y/o secuenciación, con la ejecución de la investigación se esperan implementar evaluaciones de la presencia de algunos de dichos virus mediante LAMP a partir de extractos crudos, lo que en la actualidad se constituye en uno de los principales campos de investigación en los estudios etológicos en diferentes patosistemas, dada la posibilidad de su utilización en laboratorios no especializados en biología molecular y en la disminución de los costos asociados a la detección de patógenos. En particular inicialmente se evaluará la técnica de LAMP para la detección de virus de tomate de importancia económica mundial tales como el tobamovirus: Tomato brown rugose fruit virus (ToBRFV) y el amalgavirus: Southern tomato virus (STV). Adicionalmente, se plantea el diseño de una prueba de LAMP para la detección asintomática del Potato yellow vein virus (PYVV), uno de los virus de mayor importancia económica en tomate y otras solanáceas en Colombia, y para el cual no existen métodos comerciales rápidos de diagnóstico. Se espera que los resultados de esta investigación puedan ser utilizados por la cadena hortofrutícola como base para el establecimiento de programas de certificación de semilla de tomate, mejoramiento genético y vigilancia cuarentenaria de virus emergentes y reemergentes en Antioquia y en otros departamentos productores de esta hortaliza en el país.
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:CONVOCATORIA FORTALECIMIENTO A LA INVESTIGACIÓN FACULTAD DE CIENCIAS 2023
Modalidad:Modalidad única: Apoyar las labores de los docentes de la Facultad de Ciencias con el propósito de fomentar su visibilidad, el intercambio de conocimiento y la formación de estudiantes
Responsable