El método computacional TARIS (del Grupo de Química Teórica de la Universidad Nacional) ha logrado solventar en gran medida la necesidad de comparar moléculas independientemente del alineamiento. Sin embargo, es necesario mejorar los tiempos de ejecución de los algoritmos a través de implementaciones paralelas de los mismos, e incluir otras medidas de similitud entre árboles distintas a la distancia de edición.