El centro de origen de la yuca cultivada corresponde a la región de la cuenca del rio Amazonas, concentrándose allí la mayor diversidad. Esta diversidad ha sido conservada por las comunidades indígenas amazónicas desde la domesticación de su cultivo y favorecida por el desarrollo de chagras, en las cuales la yuca tiene un papel protagónico. En la diversidad de yucas amazónicas se puede encontrar la fuente de genes para el mejoramiento de caracteres de interés agrícola y nutricional. Sin embrago, dada la occidentalización y la desvalorización del conocimiento indígena, las practicas agrícolas como las de la chagra se han ido perdiendo. Las mujeres chagreras que custodias de la diversidad de yuca ya son de avanzada edad y no tienen a quien legar su conocimiento y variedades. De esta manera la conservación de la diversidad de yuca en la amazonía está en riesgo. Frente a esta problemática un eje central de este proyecto consistirá en desarrollar diferentes actividades de investigación participativa que permitan documentar y revalorar la diversidad cultural y el saber indígena alrededor de la chagra como un refugio de la diversidad de yuca amazónica. Se levantará información del sistema de chagra como un modelo de sistema agroecológico y se desarrollarán estrategias de divulgación científica que visibilice este conocimiento y que permita desarrollar algunas estrategias de conservación. Así mismo se realizarán encuentros de diálogos de saberes en donde las mujeres chagreras transmitan su conocimiento a la comunidad académica y científica. Por otro lado, la yuca amazónica en su gran diversidad es potencial fuente de genes para rasgos de interés agronómico y nutricional como la resistencia a la bacteriosis vascular y el contenido de cianuro. La bacteriosis es la principal enfermedad bacteriana del cultivo. La mejor estrategia para el control de esta enfermedad es aprovechar los mecanismos naturales (gobernado por genes) que las plantas han desarrollado para defenderse. El cianuro es un compuesto de la yuca, lo que ha permitido su clasificación en dulces (bajo contenido) y amargas (alto contenido). Las hojas presentan altos contenidos de cianuro que las raíces, lo que ha hecho que no sean consumidas pese a su gran valor nutricional. La identificación de genes y sus variantes alélicas en una población de variedades de yuca amazónicas representa un punto de partida esencial para el desarrollo de variedades mejoradas. En este proyecto se aprovechará la información disponible en nuestros grupos de investigación sobre la secuenciación parcial de genomas, GBS, de un set de variedades de yucas amazónicas para mediante estudio de mapeo por asociación cruzarla con la de fenotipificación e identificar genes candidatos implicados en estos dos rasgos. Para la resistencia a la bacteriosis se inoculará el grupo de variedades con la cepa Xpm681 y se realizará el seguimiento de síntomas para calcular el AUDPC y determinar el nivel de resistencia de las variedades frente a la infección. La expresión de los genes candidatos se evaluará en las dos variedades mas contrastantes (resistente y susceptible) a las 48 horas post-inoculación. Las hojas y raíces de las mismas variedades serán colectadas a los seis meses y se someterán a la cuantificación de cianuro mediante un protocolo ya establecido en nuestros laboratorios, para luego realizar un GWAS para este rasgo. La validación funcional de los genes implicados en los dos rasgos se realizará en un primer caso diseñando y construyendo proteínas artificiales tipo TALs (arTALs), las cuales tienen la capacidad de dirigirse específicamente al promotor de genes blanco para así inducir su expresión. En paralelo y como un primer paso hacia el desarrollo de una plataforma de validación funcional mediante CRISPR se realizará el diseño y construcción de vectores que contengan la secuencia codificante de la proteína Cas-9 y RNAs guías dirigidos a tres de los genes mas importantes identificados para los dos rasgos.