Proyectos
CONOCIENDO NUESTROS RECURSOS CRIOLLOS: ANÁLISIS GENÓMICO Y BUSQUEDA DE REGIONES DEL GENOMA ASOCIADAS A CARACTERÍSTICAS PRODUCTIVAS, REPRODUCTIVAS Y DE SALUD EN GANADO BLANCO OREJINEGRO (BON)
Resumen
Éste proyecto, planteado por la Universidad Nacional de Colombia Sede Medellín, en alianza con la Universidad Tecnológica de Pereira, tiene como objetivo evaluar el perfil genómico de la raza criolla colombiana Blanco Orejinegro (BON), que es un recurso genético colombiano en vía de extinción y su asociación con características productivas, reproductivas y de salud. Se analizarán 300 bovinos puros BON, distribuidos en diferentes hatos de los departamentos de Antioquia y el Eje cafetero; se extraerá plasma y DNA de sangre y DNA de semen de toros que ya no existan pero de los que se tengan pajillas. Se hará genotipificación con el chip GGP¬LD de Neogen, el cual abarca 26000 marcadores SNP's a lo largo del genoma bovino, y se hará diagnóstico serológico con la técnica ELISA indirecta para las enfermedades leucosis bovina, diarrea viral bovina y neosporosis canina. Los datos serán depurados mediante el software SAS y Plink 1.07 y la imputación de datos se hará con el software Beagle. Con el software MTDFREML (BLUP) serán estimados los valores de cría convencionales (EBV) mediante un modelo animal univariado basados en el método de máxima verosimilitud restricta libre de derivadas. La estimación de los efectos de sustitución alélica de los SNPs y valores de cría genómicos (GEBVs) será realizada empleando el método Bayes C utilizando el software GS3. Con la ejecución de este proyecto, se espera conocer el efecto de algunos SNP's sobre características de importancia económica en la raza BON e identificar animales con superioridad genética candidatos a la selección. Además de ello, se fortalecerá el conocimiento ligado al análisis y uso de información genómica en ganado criollo colombiano, en virtud de promover y generar fundamentos investigativos y prácticos que repercutan de forma positiva en la conservación y utilización de los recursos zoogenéticos colombianos. Se debe resaltar que el desarrollo de este proyecto ayudará a conocer la diversidad y la ancestría de este recurso genético colombiano, clasificado como raza en vía de extinción, e incluso se puede utilizar como método de trazabilidad en la raza, además, permitirá la identificación de genes de importancia y ayudará a entender la arquitectura genética de los diferentes caracteres productivos, reproductivos y de salud en ganado BON en Colombia
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:Convocatoria externa
Modalidad:Convocatoria externa
Responsable