En el presente proyecto de investigación se propone el estudio analítico y numérico de un sistema que modela la degradación de microorganismos con biopelículas en un reactor continuo de tanque agitado (RCTA) para el tratamiento de aguas residuales. Inicialmente se trabajará siguiendo el sistema planteado en [1], es decir, como un sistema dinámico suave en el que se analizarán los puntos de equilibrio del sistema y su respectiva estabilidad. Además en el caso de encontrar bifurcaciones se procederá a caracterizarlas y a determinar la posible de caos. Posteriormente se aproximará la cinética de Monod mediante rectas a tramos para convertir el sistema originalmente suave en uno no suave, ésto con el fin de ver el comportamiento del reactor y qué tanto afectan ahora los parámetros de bifurcación al sistema. Se analizará el nuevo sistema obtenido usando técnicas de la dinámica no lineal aplicando el método convexo de Filippov y caracterizar las posibles bifurcaciones que se encuentren. La simulación numérica se realizará utilizando el lenguaje de programación Matlab, y para el caso en el que el sistema es suave se utiliza además el toolbox de matlab llamado Matcont.