La ganadería es una de las actividades pecuarias más importantes para la economía colombiana, sin embargo su rentabilidad y competitividad se ven afectadas por las estrategias de selección implementadas actualmente, en la cuales se debe esperar hasta la edad adulta del animal para evaluar su desempeño productivo y reproductivo. Los programas de mejoramiento genético implementados en las lecherías colombianas se han enfocado principalmente en la obtención de mayores volúmenes de producción, y en los últimos años en el mejoramiento de las características de calidad de leche pero se ha dejado a un lado la eficiencia reproductiva de los animales afectando el rendimiento y la rentabilidad del sistema productivo. De esta manera se evidencia la necesidad de implementar nuevas tecnologías que permitan el mejoramiento de los sistemas de producción, como la selección asistida por marcadores moleculares la cual optimiza el progreso genético y aumenta la confiabilidad de los resultados. El objetivo de este trabajo es conocer las asociaciones alélicas y genotípicas del polimorfismo del exón 6 del gen POU1F1 con características productivas, reproductivas y de calidad de leche para vacas Holstein en el departamento de Antioquia. Para esto se analizará la información productiva y reproductiva de 500 vacas Holstein pertenecientes a diferentes hatos del departamento de Antioquia. Estos individuos serán genotipificados con la técnica PCR-RFLP. La asociación del polimorfismo del gen POU1F1 con los parámetros productivos, reproductivos y de calidad de leche se realizará mediante un modelo lineal mixto y se determinarán las frecuencias alélicas y genotípicas para evidenciar si se encuentran en equilibrio de Hardy-Weinberg. La diversidad genética se evaluará comparando la proporción de los diferentes genotipos dentro de las subpoblaciones mediante la heterocigosidad observada y la esperada. La estructura genética se analizará mediante los estadísticos F de Wright. Con esta investigación se espera determinar las variantes alélicas y genotípicas más favorables para el mejoramiento de las características de importancia económica más evaluadas en los sistemas de producción lecheros. Además se espera determinar la utilidad de este polimorfismo en los programas de selección asistida por marcadores moleculares que permitan mejorar la eficiencia y rentabilidad de los hatos ganaderos haciéndolos más competitivos a nivel nacional e internacional.