El sector lechero es uno de los más importantes renglones en la producción agropecuaria de Colombia y, especialmente, de Antioquia. Su crecimiento en los últimos años se debe al mejoramiento en las técnicas de manejo, producción, reproducción y especialmente a la tecnificación. El conocimiento de los diferentes factores internos y externos que intervienen en los sistemas de producción permite su control y regulación por parte del productor, lo que se verá reflejado en la optimización del uso de recursos, el mejoramiento de las condiciones sanitarias y de bioseguridad, trazabilidad del proceso productivo y aumento de la producción. Uno de los principales factores que influyen en el sistema de producción son las enfermedades. Cada enfermedad tiene un impacto sobre el hato y su desempeño, y la capacidad de prevenirla, contenerla o eliminarla, tanto por parte del animal (respuesta inmune o inmunocompetencia) como por parte del productor, es determinante del sostenimiento y rentabilidad del sistema. La respuesta fisiológica a los patógenos depende en gran medida de la competencia e integridad del sistema inmunológico en el momento de la infección y del desarrollo de la enfermedad. La supresión del sistema inmunológico puede ser generada por agentes de naturaleza química, como toxinas, medicamentos u otro tipo de moléculas endógenas o exógenas; o biológica, como virus, bacterias o parásitos. Dentro de éstos agentes biológicos inmunosupresores en el ganado bovino se encuentran el herpesvirus bovino tipo 1. El herpesvirus bovino tipo 1 (BoHV1) es un virus del Grupo I (dsDNA), orden Herpesvirales, familia Herpesviridae, subfamilia Alphaherpesvirinae, género Varicellovirus. Dentro de las enfermedades que produce están la rinotraqueitis infecciosa bovina (IBR), la vulvovaginitis o balanopostitis pustular infecciosa, conjuntivitis y está altamente relacionado a la enfermedad respiratoria bovina, la cual integra otro tipo de agentes patógenos y fisiológicos propios del animal. Una de las mejores formas para prevenir y controlar éste tipo de enfermedades en los hatos bovinos es la selección asistida por marcadores moleculares (SAM), que permite identificar animales con alelos que otorgan resistencia o susceptibilidad a determinadas enfermedades y seleccionar, con algún grado de intensidad, los animales que se desea transmitan éstas facultades a la descendencia, que, finalmente, será el futuro del hato y del sistema de producción. El gen TLR6, relacionado con el sistema inmunológico del animal y con su respuesta a los patógenos, ha sido reportado como gen objetivo para la SAM por la asociación que se ha encontrado entre algunos de sus alelos y la resistencia a algunas enfermedades. Éste trabajo pretende diagnosticar la infeccion con el virus de IBR en bovinos de varios hatos lecheros de la subregión Norte del departamento de Antioquia mediante técnicas serológicas (ELISA específica para anticuerpos anti-BoHV1). Ademas, mediante técnicas moleculares (PCR-RFLP), genotipificar cada animal para los polimorfismos C1859A y A1980G del gen TLR6, para realizar una asociación estadística entre los genotipos y la enfermedad, y encontrar así alelos de resistencia, neutralidad y susceptibilidad. Sumado a esto, también se asociarán los alelos y la enfermedad con algunos parámetros productivos y reproductivos. Con la información productiva y reproductiva, se optimizará el análisis haciendo un esquema completo de la importancia de cada animal sobre el hato y se harán recomendaciones generales con base en los resultados de las asociaciones y la identificación de factores de riesgo. Éste estudio será pionero en la correlación de una enfermedad inmunosupresora como IBR, para la que no hay programas nacionales de erradicación, con los parámetros de interés económico para los sistemas productivos y con los polimorfismos del gen TLR6 para los que tampoco se ha descrito ninguna relación de resistencia o susceptibilidad.