En la actualidad la exploración de microorganismos y la obtención de derivados naturales (metabolitos o compuestos) a partir de fuentes biológicas con gran potencial como los insectos vectores de enfermedades, representa una alternativa sustentable y atractiva, para la generación de nuevo conocimiento y como base para la utilización de nuevas medidas de control biológico o plataformas virales dirigidas a mitigar el impacto en salud pública de las enfermedades tropicales. El desarrollo exitoso de estas estrategias depende en gran parte del conocimiento del microbioma y viroma de los vectores y de su relación con los parásitos y patógenos que trasmiten. Entre los insectos que generan mayor riesgo para la transmisión de enfermedades de importancia médica y veterinaria en América, se encuentran los dípteros del género Lutzomyia (Psychodidae) y del género Aedes (Culicidae). El primero potencialmente vector de diferentes especies del parásito Leishmania y el segundo de numerosos virus como el Zika, el dengue y el chikungunya. Algunas especies de Lutzomyia han sido también encontradas infectadas con flebovirus. Ambos géneros incluyen especies destacadas por su papel vectorial como: Lutzomyia (Lu.) evansi, vector de Leishmania infantum, encontrado infectado naturalmente por Leishmania braziliensis; Aedes (Ae) aegypti y Aedes (Ae) albopictus, por la transmisión de virus como dengue y fiebre amarilla. Estas especies reconocidas por su gran capacidad de adaptación a ambientes urbanos y periurbanos, competencia vectorial, alta abundancia y desplazamiento de especies, representan un interés particular en actividades biovigilancia y biocontrol con ingentes esfuerzos de las autoridades responsables. A pesar de ello, los esquemas actuales no son lo suficientemente efectivos y aunque se sustentan en estrategias integradas dirigidas hacia el vector como la eliminación de criaderos naturales, la modificación del entorno ambiental y la aplicación de insecticidas, aspectos como la resistencia y el cambio climático, demandan la búsqueda de alternativas innovadoras y costo-efectivas. En este sentido enfoques como el control con endosimbiontes, dentro de los cuales están la bacteria Wolbachia, están siendo evaluados y bajo investigación para virus dengue y con la especie vectora principal, Aedes aegypti en Colombia. La alianza que se presenta entre los grupos de investigación en Sistemática Molecular, Microbiodiversidad y Bioprospección de la Universidad Nacional de Colombia y el grupo Biomédicas de la Universidad de Sucre, pretende generar nuevo conocimiento relacionado con microbioma y viroma de Lutzomyia y Aedes respectivamente. Se busca evaluar el impacto que tiene el endosimbionte Wolbachia sobre la microbiota intestinal y el establecimiento de Leishmania en una población natural de Lutzomyia evansi del norte de Colombia, sobre la base de estudios previos y originales que demuestran la presencia estable de Wolbachia en esta especie. Posterior a la infección experimental de Le. infantum en Lu. evansi, serán obtenidos los tractos digestivos y sometidos a diferentes tratamientos con la bacteria. La microbiota total presente será secuenciada por Ilumina MiSeq. El análisis de los datos mediante el pipeline DADA2, ofrecerá ventajas para la inferencia de secuencias variantes de amplicones (Amplicon Sequence Variants-ASVs) y posterior comprensión de la diversidad con el paquete phyloseq, para apreciar si Wolbachia es un Keystone (Taxa determinante del core) y si juega un rol inductor o protector ante la infección por Leishmania. Adicionalmente se caracterizará el viroma de Aedes spp y en particular la familia Mesoniviridae, por ser considerada entre los virus específicos de insectos con gran potencial en control biológico o para la generación de plataformas de búsquedas de nuevas vacunas. Se busca mediante el uso de técnicas virológicas y moleculares aislar y caracterizar los virus a partir de grupos de mosquitos provenientes de campo estima