A nivel mundial la demanda de aguacate ha aumentado en los últimos años, y controlar su calidad se ha vuelto un reto. Este cultivo es considerado una de las principales apuestas exportadoras del país y se ve principalmente afectado por los trips, insectos plaga que causan problemas fitosanitarios como resultado de su alimentación tanto en flores como hojas y frutos. La plaga genera deformaciones en los órganos en los que se aloja, reduciendo la calidad y valor de la fruta en el mercado. Los trips son difíciles de controlar por la diversidad de hospedantes que ataca, su alta tasa de reproductividad, la resistencia a insecticidas y por tener un número limitado de enemigos naturales. Debido a la poca información reportada de los trips en Colombia y Antioquia en el cultivo de aguacate, esta investigación tiene como objetivo caracterizar las poblaciones de trips (Thysanoptera: Thripidae) procedentes de cultivos comerciales de aguacate (Persea americana Mill.) del Oriente antioqueño y estudiar la diversidad microbiana asociada a este insecto plaga. Para ello se realizarán colectas en la variedad de aguacate Hass en fincas ubicadas en diferentes municipios del Oriente antioqueño. Para la identificación de especies de trips se realizará la extracción de ADN total sin dañar el insecto para el estudio taxonómico, se amplificará la región mitocondrial citocromo oxidasa I (COI) y la región espaciadora interna transcrita (ITS) y se enviarán a secuenciar. Por otro lado, para el estudio la microbiota asociada a trips se realizará la extracción de ADN total a partir de pools de 25 individuos de trips, luego se realizará amplificación de la región entre los genes ribosomales 16S-23S y de las regiones variables V3-V5 del gen ribosomal 16S. Los amplificados serán separados en geles de poliacrilamida por el método de Electroforesis en gel de Gradiente de Temperatura Temporal (TTGE). Después del análisis electroforético algunos amplificados serán seleccionados para secuenciar por el método de Sanger y por medio de secuenciación de última generación.