El funcionamiento de las tecnologías de tratamiento de aguas residuales depende de una combinación de factores físicos, químicos y biológicos. Durante muchas décadas, estos sistemas se basaron únicamente en la información acerca de los parámetros físico-químicos, aprovechando exitosamente las ventajas del vasto potencial metabólico de las comunidades microbianas, sin conocimientos detallados sobre los organismos involucrados. Se estima que el 90% de los microorganismos presentes en la naturaleza han escapado a los tradicionales métodos de cultivo. Por lo tanto el mayor desafío en ecología microbiana ha sido acceder a la diversidad y estructura de las comunidades naturales de microbios. El campo de la biología molecular ha avanzado con tecnologías innovadoras que han permitido nuevos descubrimientos. La habilidad para extraer y aislar el DNA, la amplificación de genes por PCR de grupos específicos de microorganismos y la obtención de datos de las secuencias del gen ahora son eventos rutinarios para inferir relaciones filogenéticas y elucidar la diversidad microbiana. De acuerdo a ello, el objetivo del presente trabajo es caracterizar la diversidad microbiana asociada a una planta de tratamiento de aguas residuales (PTAR) usando métodos dependientes e independientes de cultivo (métodos moleculares). Adicionalmente, en este proyecto se pretende la búsqueda de aislados con propiedades de hidrólisis de ácidos grasos, por su potencial interés biotecnológico para el desarrollo de procesos previos a los tratamientos biológicos tradicionales.