Los hongos del género Fusarium constituyen un grupo de gran variabilidad genética y de difícil clasificación. Fusarium está dividido en secciones, una sección agrupa especies con características morfológicas similares. Las especies pueden estar subdivididas en formas (cepas morfológicamente similares caracterizadas por su adaptación a un hospedero, o rango de hospederos, en particular) y éstas, a su vez, en razas. Investigaciones realizadas con técnicas moleculares han revelado una complejidad genética del grupo aún mayor, no concordante en muchos casos con la clasificación antes descrita. Por ejemplo, una especie tan importante, por su patogenicidad a plantas y actualmente a humanos, como F. oxysporum se ha descrito como un grupo polifilético. Razón por la cual, aislamientos que pertenecen a una misma forma de F. oxysporum pueden tener grandes diferencias genéticas producto de un origen diferente. Elucidar la variabilidad genética a nivel de cepas causantes de enfermedades a humanos es un prerrequisito para entender su epidemiología y determinar un tratamiento adecuado del paciente. La capacidad patogénica de estos hongos oportunistas está relacionada con la resistencia del hongo a antimicóticos, con el aumento de personas inmunosuprimidas y con condiciones ambientales favorables al hongo por lo que se prevé que su incidencia en humanos sea cada vez mayor. En Colombia, el laboratorio de Micología Médica de la Facultad de Medicina de la Universidad de Antioquia ha reportado un incremento anual del 211% de casos, entre 1990 y 2000 y la Unidad de Micología Médica y Experimental de la Corporación para Investigaciones Biológicas (CIB) del 317% entre 1995 (29 aislamientos) y 2003 (92 aislamientos). Sin embargo, en estos centros de referencia a nivel nacional en micología médica el diagnóstico de la especie no se realiza porque este se basa tradicionalmente en caracteres morfológicos, pero a nivel de especie muchos de estos caracteres presentan gran variación y en laboratorio pueden alterarse por las condiciones de cultivo. Determinar las especies es importante ya que estas tienen diferente susceptibilidad a los antimicóticos o pueden ser incluso resistentes. Actualmente, el Laboratorio de Biotecnología Microbiana, de la Universidad Nacional sede Medellín en convenio con la Unidad de Micología Médica y Experimental de la CIB adelantan un proyecto para establecer un protocolo fundamentado en técnicas moleculares que permita identificar la especie a la que pertenecen los aislamientos de Fusarium obtenidos de muestras clínicas. Sin embargo, dada la diversidad genética que se ha reportado a nivel de especie, en este nuevo proyecto se tiene como objetivos estudiar la variabilidad de Fusarium a nivel intraespecífico por PCR con un cebador minisatélite del bacteriófago M-13 y con un cebador que corresponde a una secuencia simple de DNA repetido (GACA)4, hacer un análisis filogenético por secuenciación de los genes ITS1, ITS2 y del factor de elongación de la traducción 1alfa, y describir las características morfológicas de las cepas, para determinar si las características moleculares ayudan a predecir un determinado fenotipo. La metodología propuesta permitirá analizar y seleccionar los genotipos diferentes para estudiar su filogenia y su susceptibilidad a antimicóticos. Esta investigación contribuirá a hacer un diagnóstico más preciso del agente etiológico de fusariosis en humanos y al conocimiento de su epidemiología al relacionar un genotipo con una patología determinada. Es preciso destacar finalmente que la metodología propuesta y los cebadores a utilizar permiten obtener resultados rápidos, con bajo costo, y sobretodo con gran poder de resolución para la discriminación de genotipos.