Los hongos del género Fusarium constituyen un grupo muy heterogéneo y difícil de clasificar. Sus especies pueden tener distribución mundial o estar limitadas a hábitats más o menos especializados, donde actúan como saprófitos o parásitos. Algunas de sus especies son patógenos de plantas, causantes de enfermedades de gran importancia económica en cultivos agrícolas. Varias de éstas han cobrado mayor importancia al presente debido a su incremento paulatino como gérmenes patógenos para el hombre y animales. La capacidad patogénica de estos hongos oportunistas está relacionada con la resistencia del hongo a antimicóticos, con el aumento de personas inmunosuprimidas y con condiciones ambientales favorables al hongo por lo que se prevee que su incidencia en humanos sea cada vez mayor (Nelson et al., 1994). En Colombia, el laboratorio de Micología Médica de la Facultad de Medicina de la Universidad de Antioquia ha reportado un incremento anual del 211% de casos, entre 1990 y 2000 (Escobar y Carmona, 2003), y la Unidad de Micología Médica y Experimental de la Corporación para Investigaciones Biológicas (CIB) del 317% entre 1995 (29 aislamientos) y 2003 (92 aislamientos). Fusarium es actualmente uno de los hongos patógenos humanos más comunes e importantes. La taxonomía de Fusarium se basa tradicionalmente en caracteres morfológicos, pero a nivel de especie muchos de estos caracteres presentan gran variación y en laboratorio pueden alterarse por las condiciones de cultivo. La identificación a nivel de especie es difícil y rara vez es reportada (Nelson et al., 1994). En Colombia, el diagnóstico de la especie es infrecuente. La determinación precisa de las especies de Fusarium es un prerrequisito para estudios de dispersión, infección y tratamiento del hospedero. Las técnicas moleculares han permitido un gran avance en taxonomía de microorganismos. Las regiones del DNA ribosomal (DNAr) han sido muy utilizadas ya que son universales en los organismos vivos poseyendo partes altamente conservadas y otras variables que pueden ser características de una especie. Estudios filogenéticos obtenidos por secuenciación de regiones del DNAr de Fusarium han sido exitosos en la diferenciación de especies (Hennequin et al., 1999; Mule et al., 1997; O’Donell et al., 1998; Summerbell and Schroers, 2002) y protocolos basados en la reacción en cadena de la polimerasa (PCR) del DNAr han sido efectivos para la detección de algunas especies de Fusarium (Hue et al., 1999; Jaeger et al., 2000; Mishra et al., 2003; Yera et al., 2003). En este trabajo pretendemos identificar a nivel de especie por medio de la PCR del DNAr cepas de Fusarium patógenas para el hombre, las que fueron obtenidas de pacientes de la Unidad de Micología Médica y Experimental de la Corporación para Investigaciones Biológicas (CIB) en el período 2004-2005. La metodología propuesta permitirá obtener un protocolo económico, rápido y sencillo para la detección de especies de Fusarium, lo que permitiría un efectivo y oportuno tratamiento.