Para abastecer las 30.000 toneladas anuales de caucho que requiere el país, el gobierno proyecta contar con 20.000 hectáreas plantadas para 2006. Los resultados de los programas de siembra sólo se verán, en promedio entre 7 y 10 años después de plantación, el cumplimiento de este objetivo debe contemplar el control riguroso del material vegetal de Hevea brasiliensis a propagarse masivamente. El país posee 37 jardines clonales, que no cuentan con un claro registro histórico de procedencia de su material, solo las colecciones de Clones de caucho del Instituto SINCHI y Paraguaycito (Federación Nacional de Cafeteros), poseen la información histórica de más de 70 clones que las conforman. Aunque siete jardines han sido certificados por Isoenzimas (sólo uno de forma amplia), esta metodología tiene limitantes de consistencia, polimorfismos insuficientes y baja reproducibilidad, por que la respuesta detectada obedece a la expresión de genes que puede estar influenciada por condiciones ambientales. Adicionalmente se realiza mediante el análisis de mezclas de extractos proteicos de varios individuos muestreados, lo que disminuye la significancia real estadística del muestreo, dada su limitada discriminación. El desarrollo de la biología molecular en los últimos años ha generado múltiples marcadores moleculares: RFLPs, RAPDs, AFLPs y microsatélites, los cuales se han empelado en la fidelidad genética de material propagado o micropropagado en conservación ex situ, en especies forestales donde la identidad genética debe mantenerse y conocerse, obviando esperar el desarrollo en campo o la etapa de producción y en la caracterización de recursos genéticos vegetales. Estas técnicas moleculares evalúan las variaciones a nivel del ADN entre individuos de un mismo clon, o entre individuos de diferentes clones, no dependen de la expresión de un gen, si no de la secuencia misma del genoma, haciendolas más sensibles, con mayor poder de discriminación y reproducibilidad que otros marcadores moleculares como las isoenzimas. Aunque el país cuenta con infraestructura y personal calificado para establecer técnicas de propagación masiva de material vegetal, se requiere de procesos confiables de certificación del material existente en los jardines clonales que garanticen la homogeneidad genotípica y la identidad del material a propagar. Este proyecto plantea dos actividades: i) Obtener patrones moleculares por microsatélites para la discriminación de clones de uso comercial en las colecciones de caucho del Instituto SINCHI y/o Paraguaycito (Jardínes Tipo II) y su posterior aplicación en los jardines clonales Tipo IV en plena etapa de producción (Asoheca, Mavalle, Cauchopar, Llanocaucho, Matazul y Arboledax) para la validación de estos clones y la homogeneidad de los mismos. ii) Diseñar una metodología eficiente para la certificación del material vegetal validado en campo, que permita realizar un seguimiento de la identidad genética de los clones presentes en jardines y plantaciones comerciales. A través de la transferencia de la tecnología, se pondrá a disposición de la Cadena Productiva del Caucho Natural y su Industria, una herramienta que contribuirá a tener clones con identidad genotípica conocida, controlar la filialidad genética del material propagado de cada clon evaluado y seleccionado satisfactoriamente para su propagación en Colombia.