--La giardiasis, es la infección intestinal causada por Giardia duodenalis , es el parásito más común en todo el mundo, se presente tanto en países desarrollados como en países en vías de desarrollo . La prevalencia en población escolar en Colombia se encuentra entre 13% - 61% . Los genotipos de Giardia tienen un papel importante en las manifestaciones clínicas de la enfermedad pues existen diferentes presentaciones clínicas relacionadas con los distintos genotipos. Además, los genotipos permiten ubicar la fuente de infección. El principal método utilizado para la diferenciación por ensamblajes de Giardia, es la PCR – FRLP (polimorfismo de fragmentos de restricción). Este estudio pretende realizar el diagnóstico molecular y caracterización de Giardia duodenalis en indígenas menores de 15 años de Puerto Nariño (Amazonas).