Colombia se considera uno de los países con mayor diversidad en el planeta y por consiguiente posee un recurso natural invaluable. Es imprescindible, sin embargo, conocer en profundidad esta biodiversidad para lograr así aprovechar todo su potencial. Dentro de esta biodiversidad existe un desconocimiento de la vida microbiana, y sobre todo de su potencial, debido en gran parte a que la mayoría de los microorganismos presentes en el ambiente no son cultivables. En respuesta a esta dificultad ha surgido la metagenómica, estrategia que se define como el análisis del contenido genómico total de una comunidad, ya que complementa enfoques descriptivos y permite acceder y valorizar la riqueza biológica no cultivable. El auge de la genómica se ha dado a la par con el desarrollo de herramientas bioinformáticas que hoy en día hacen posible descripciones globales de sistemas biológicos y sus rutas metabólicas y el estudio de procesos que van desde la célula hasta ecosistemas. La presente propuesta de investigación está orientada a consolidar la capacidad nacional para hacer estudios genómicos, y específicamente metagenómicos para explorar y valorar la diversidad microbiana de ambiente extremos, a través de la conformación del Centro Colombiano de Genómica y Bioinformática de Ambientes Extremos (GeBiX) que reunirá los esfuerzos de 14 grupos de investigación en 7 instituciones del país. Se tomará como modelo de estudio el Parque Nacional Natural de los Nevados que contiene diferentes ambientes extremos, como el páramo y manantiales termales. Estos ambientes representan ecosistemas de propiedades únicas y son fuente valiosa de organismos, genes y enzimas que pueden tener una amplia gama de aplicaciones. Para iniciar, se tamizarán librerías por función y por secuencia para identificar productos de interés industrial. La bioinformática permitirá el almacenamiento, procesamiento, la disponibilidad, consulta y administración de la información biológica recolectada para identificar productos que pueden ser de interés en industrias como la oleoquímica, farmacéutica, cosmética y la producción de biocombustibles, entre otras. El Centro también realizará análisis de secuencias obtenidas del ADN ambiental, como complemento a la búsqueda de productos con el fin de analizar el contenido genético presente en estos ecosistemas. De esta manera se espera describir la diversidad microbiana presente y el contenido metabólico representado en estas comunidades. La fortaleza en capacidades e intereses de los investigadores que conformarían el Centro es una de sus grandes ventajas puesto que asegura una mayor participación de grupos científicos nacionales, en interacción con asesores nacionales e internacionales, con el fin de enriquecer el diálogo y la dinámica de trabajo. A pesar de la limitación actual de recursos, la inclusión de diversos grupos en esta propuesta busca crear una infraestructura participativa que al cabo de los dos primeros años pueda ser expandida mediante la apropiación de recursos adicionales nacionales e internacionales.