Proyectos
Diagnóstico en campo de tuberculosis bovina en la región de Sumapaz. Fase 2: evaluación y validación de un método rápido basado en amplificación isotérmica
Resumen
El presente proyecto se enmarca en la implementación de sistemas rápidos y eficientes de diagnóstico de tuberculosis bovina (TBB), con el objetivo de mejorar la productividad y sostenibilidad de las unidades productivas ganaderas de la región de Sumapaz, asegurando la inocuidad de los productos lácteos destinados a comercialización tanto a nivel interno como en mercados internacionales. Tradicionalmente, el diagnóstico de TBB se realiza mediante la aplicación de la Tuberculina, un ensayo indirecto que falla en la adecuada predicción de casos activos y muestra reacción cruzada con micobacterias ambientales. Por otro lado, el diagnóstico convencional en laboratorio mediante microscopía de TBB, causada por Mycobacterium bovis, implica el aislamiento de bacilos ácido-alcohol resistentes y tinción Ziehl-Neelsen, lo que implica baja sensibilidad y períodos largos de espera entre 6-8 semanas. Por lo tanto, la disponibilidad de métodos más sensibles y específicos contribuye definitivamente al control de la TBB. Por lo tanto, es prioritario desarrollar alternativas con mayor confiabilidad y sensibilidad para diagnosticar la presencia de patógenos zoonóticos en cualquier etapa, previniendo su diseminación en el ámbito agropecuario. Durante una fase previa a esta investigación, en el desarrollo de en un proyecto financiado en la primera convocatoria conjunta de la Universidad Nacional y la Universidad de Cundinamarca, pudimos establecer que el diagnóstico de TBB mediante el aislamiento microbiológico muestra demasiados inconvenientes prácticos, que incluyen la necesidad de utilizar medios de cultivo especiales, procedimientos costosos, experiencia y tiempo, lo que no garantiza el éxito en los resultados obtenidos. Estos resultados nos motivaron a la búsqueda de alternativas de diagnóstico de menor complejidad que pudieran ser llevadas a campo. En esta búsqueda concluimos que los métodos moleculares basados en PCR ofrecen mayor sensibilidad y rapidez. Sin embargo la PCR convencional continúa teniendo un alto costo y requieren equipos y reactivos especializados, contrastando con la necesidad de un método con bajos requerimientos técnicos, fácil acceso de tipo “point of care” que pueda ser llevado a campo. Por lo tanto en esta segunda fase, la presente propuesta propone validar y establecer el potencial uso de una variante de la PCR denominada amplificación isotérmica mediada por bucles o LAMP, un método novedoso, rápido, económico y de baja complejidad que puede ser aplicado para el diagnóstico de la TBB en campo. Específicamente proponemos la amplificación de una región específica del genoma de M. bovis mediante LAMP, de utilidad para identificar y diferenciar esta micobacteria de otros miembros del complejo tuberculoso. Por sus propiedades, el método de La LAMP permite ser ejecutado en condiciones isotérmicas (63-65 °C) sin la necesidad de utilizar un termociclador y obteniendo un resultados en solo 60 minutos. Esta técnica tiene un costo relativamente bajo en comparación con otras técnicas de detección molecular, además que no necesita de personal especializado para su ejecución. Durante el proceso de validación, proponemos determinar por LAMP la presencia de M. bovis en ADN extraído de leche (positivas y negativas) obtenidas de la zona rural con ganadería de los municipios de Pasca, Fusagasugá o Silvania, seleccionadas a partir de los resultados obtenidos en la primera fase de este proyecto. Los resultados se compararán con el diagnóstico convencional de TBB utilizando Tuberculina como prueba estándar. Se pretende que para una tercera fase de esta investigación se pueda proponer un prototipo de diagnóstico rápido y fácil utilizable en directamente en unidades de producción ganadera no solo de la región de Sumapaz sino de todo el territorio colombiano.
Convocatoria
Nombre de la convocatoria:CONVOCATORIA DE PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN CONJUNTOS ENTRE LA UNIVERSIDAD DE CUNDINAMARCA Y LA UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA SEDE BOGOTÁ - 2020
Modalidad:CONVOCATORIA DE PROYECTOS DE INVESTIGACIÓN CONJUNTOS ENTRE LA UNIVERSIDAD DE CUNDINAMARCA Y LA UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA SEDE BOGOTÁ - 2020
Responsable